seq1 = pF1KE6236.tfa, 717 bp
seq2 = pF1KE6236/gi568815577r_36360979.tfa (gi568815577r:36360979_36561695), 200717 bp

>pF1KE6236 717
>gi568815577r:36360979_36561695 (Chr21)

(complement)

1-717  (100001-100717)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGCACGGCCGTGCAGCTTCTGGGCTTCCTGCTCAGCTTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGCACGGCCGTGCAGCTTCTGGGCTTCCTGCTCAGCTTCCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGGTGGGCACGTTGATCACCACCATCCTGCCGCACTGGCGGAGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGGTGGGCACGTTGATCACCACCATCCTGCCGCACTGGCGGAGGACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCACGTGGGCACCAACATCCTCACGGCCGTGTCCTACCTGAAAGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCACGTGGGCACCAACATCCTCACGGCCGTGTCCTACCTGAAAGGGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGATGGAGTGTGTGTGGCACAGCACAGGCATCTACCAGTGCCAGATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGATGGAGTGTGTGTGGCACAGCACAGGCATCTACCAGTGCCAGATCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGATCCCTGCTGGCGCTGCCCCAAGACCTCCAGGCTGCCCGCGCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGATCCCTGCTGGCGCTGCCCCAAGACCTCCAGGCTGCCCGCGCCCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTCATCTCCTGCCTGCTCTCGGGCATAGCCTGCGCCTGCGCCGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTCATCTCCTGCCTGCTCTCGGGCATAGCCTGCGCCTGCGCCGTCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGATGAAGTGCACGCGCTGCGCCAAGGGCACACCCGCCAAGACCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGATGAAGTGCACGCGCTGCGCCAAGGGCACACCCGCCAAGACCACCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCCATCCTCGGCGGCACCCTCTTCATCCTGGCCGGCCTCCTGTGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCCATCCTCGGCGGCACCCTCTTCATCCTGGCCGGCCTCCTGTGCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGCCGTCTCCTGGACCACCAACGACGTGGTGCAGAACTTCTACAACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGCCGTCTCCTGGACCACCAACGACGTGGTGCAGAACTTCTACAACCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGCTGCCCAGCGGCATGAAGTTTGAGATTGGCCAGGCCCTGTACCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGCTGCCCAGCGGCATGAAGTTTGAGATTGGCCAGGCCCTGTACCTGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCATCTCCTCGTCCCTCTCGCTCATTGGTGGCACCCTGCTTTGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCATCTCCTCGTCCCTCTCGCTCATTGGTGGCACCCTGCTTTGCCTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTGCCAGGACGAGGCACCCTACAGGCCCTACCAGGCCCCGCCCAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTGCCAGGACGAGGCACCCTACAGGCCCTACCAGGCCCCGCCCAGGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCACGACCACTGCAAACACCGCACCTGCCTACCAGCCACCAGCTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCACGACCACTGCAAACACCGCACCTGCCTACCAGCCACCAGCTGCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAAAGACAATCGGGCCCCCTCAGTGACCTCGGCCACGCACAGCGGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAAAGACAATCGGGCCCCCTCAGTGACCTCGGCCACGCACAGCGGGTACA

    700     .    :    .
    701 GGCTGAACGACTACGTG
        |||||||||||||||||
 100701 GGCTGAACGACTACGTG