seq1 = pF1KE6228.tfa, 780 bp
seq2 = pF1KE6228/gi568815582r_1709286.tfa (gi568815582r:1709286_1922969), 213684 bp

>pF1KE6228 780
>gi568815582r:1709286_1922969 (Chr16)

(complement)

1-105  (100001-100105)   100% ->
106-170  (100606-100670)   100% ->
171-288  (102956-103073)   99% ->
289-397  (103747-103855)   100% ->
398-501  (105699-105802)   100% ->
502-603  (105976-106077)   100% ->
604-683  (113137-113216)   100% ->
684-780  (113588-113684)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGTAGAGGTGCTGCCTGCCCTGACCGACAACTACATGTACCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGTAGAGGTGCTGCCTGCCCTGACCGACAACTACATGTACCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTGATGATGAGACCAAGGAGGCTGCCATTGTGGATCCGGTGCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATTGATGATGAGACCAAGGAGGCTGCCATTGTGGATCCGGTGCAGCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAG         GTCGTGGACGCGGCGAGAAAGCACGGGGTGAAACTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAGGTG...CAGGTCGTGGACGCGGCGAGAAAGCACGGGGTGAAACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCACAGTGCTCACCACCCACCACCACTG         GGACCATGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100642 ACCACAGTGCTCACCACCCACCACCACTGGTA...TAGGGACCATGCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CGGGAATGAGAAACTGGTCAAGCTGGAGTCGGGACTGAAGGTGTACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102968 CGGGAATGAGAAACTGGTCAAGCTGGAGTCGGGACTGAAGGTGTACGGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGACGACCGTATCGGGGCCCTGACTCACAAGATCACTCACCTGTCTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 103018 GTGACGACCGTATCGGGGCCCTGACTCACAAGATCACTCACCTGTCCACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGCAG         GTGGGGTCTCTGAACGTCAAGTGCCTGGCGACCCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103068 CTGCAGGTA...AAGGTGGGGTCTCTGAACGTCAAGTGCCTGGCGACCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTGCCACACTTCAGGACACATTTGTTACTTCGTGAGCAAGCCCGGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103782 GTGCCACACTTCAGGACACATTTGTTACTTCGTGAGCAAGCCCGGAGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CGGAGCCCCCTGCCGTGTTCACAG         GTGACACCTTGTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103832 CGGAGCCCCCTGCCGTGTTCACAGGTG...CAGGTGACACCTTGTTTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCTGGCTGCGGGAAGTTCTATGAAGGGACTGCGGATGAGATGTGTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105716 GCTGGCTGCGGGAAGTTCTATGAAGGGACTGCGGATGAGATGTGTAAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCTGCTGGAGGTCTTGGGCCGGCTCCCCCCGGACACA         AGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105766 TCTGCTGGAGGTCTTGGGCCGGCTCCCCCCGGACACAGTA...CAGAGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCTACTGTGGCCACGAGTACACCATCAACAACCTCAAGTTTGCACGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105980 TCTACTGTGGCCACGAGTACACCATCAACAACCTCAAGTTTGCACGCCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTGGAGCCCGGCAATGCCGCCATCCGGGAGAAGCTGGCCTGGGCCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106030 GTGGAGCCCGGCAATGCCGCCATCCGGGAGAAGCTGGCCTGGGCCAAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    604        GAGAAGTACAGCATCGGGGAGCCCACAGTGCCATCCACCCTGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106080 G...CAGGAGAAGTACAGCATCGGGGAGCCCACAGTGCCATCCACCCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAGAGGAGTTTACCTACAACCCCTTCATGAGAGTGAG         GGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 113180 CAGAGGAGTTTACCTACAACCCCTTCATGAGAGTGAGGTG...CAGGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 AAGACGGTGCAGCAGCACGCAGGTGAGACGGACCCGGTGACCACCATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113592 AAGACGGTGCAGCAGCACGCAGGTGAGACGGACCCGGTGACCACCATGCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GGCCGTGCGCAGGGAGAAGGACCAGTTCAAGATGCCCCGGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113642 GGCCGTGCGCAGGGAGAAGGACCAGTTCAAGATGCCCCGGGAC