seq1 = pF1KE6211.tfa, 603 bp
seq2 = pF1KE6211/gi568815592f_42073614.tfa (gi568815592f:42073614_42279400), 205787 bp

>pF1KE6211 603
>gi568815592f:42073614_42279400 (Chr6)

1-201  (100001-100201)   100% ->
202-351  (104667-104816)   100% ->
352-445  (105189-105282)   100% ->
446-603  (105630-105787)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCAACGTGATGGAGGGAAAGTCAGTGGAGGAGCTGAGCAGCACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCAACGTGATGGAGGGAAAGTCAGTGGAGGAGCTGAGCAGCACCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGCCACCAGTGGTACAAGAAGTTCATGACTGAGTGCCCCTCTGGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGCCACCAGTGGTACAAGAAGTTCATGACTGAGTGCCCCTCTGGCCAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCACCCTCTATGAGTTCCGCCAGTTCTTCGGCCTCAAGAACCTGAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCACCCTCTATGAGTTCCGCCAGTTCTTCGGCCTCAAGAACCTGAGCCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCGGCCAGCCAGTACGTGGAACAGATGTTTGAGACTTTTGACTTCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCGGCCAGCCAGTACGTGGAACAGATGTTTGAGACTTTTGACTTCAACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 G         GACGGCTACATTGATTTCATGGAGTACGTGGCAGCGCTCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTG...CAGGACGGCTACATTGATTTCATGGAGTACGTGGCAGCGCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTTGGTCCTCAAGGGGAAGGTGGAACAGAAGCTCCGCTGGTACTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104707 GCTTGGTCCTCAAGGGGAAGGTGGAACAGAAGCTCCGCTGGTACTTCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCTATGATGTAGATGGCAACGGCTGCATTGACCGCGATGAGCTGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104757 CTCTATGATGTAGATGGCAACGGCTGCATTGACCGCGATGAGCTGCTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATCATCCAG         GCCATTCGCGCCATTAACCCCTGCAGCGATA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104807 CATCATCCAGGTG...CAGGCCATTCGCGCCATTAACCCCTGCAGCGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCACCATGACTGCAGAGGAGTTCACCGATACAGTGTTCTCCAAGATTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105220 CCACCATGACTGCAGAGGAGTTCACCGATACAGTGTTCTCCAAGATTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTCAACGGGGATG         GGGAACTCTCCCTGGAAGAGTTTATAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105270 GTCAACGGGGATGGTG...CAGGGGAACTCTCCCTGGAAGAGTTTATAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGGCGTCCAGAAGGACCAGATGCTCCTGGACACACTGACACGAAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105658 GGGCGTCCAGAAGGACCAGATGCTCCTGGACACACTGACACGAAGCCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACCTTACCCGCATCGTGCGCAGGCTCCAGAATGGCGAGCAAGACGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105708 ACCTTACCCGCATCGTGCGCAGGCTCCAGAATGGCGAGCAAGACGAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :
    574 GGGGCTGACGAGGCCGCTGAGGCAGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 105758 GGGGCTGACGAGGCCGCTGAGGCAGCCGGC