seq1 = pF1KE6204.tfa, 822 bp
seq2 = pF1KE6204/gi568815576f_39775296.tfa (gi568815576f:39775296_39976112), 200817 bp

>pF1KE6204 822
>gi568815576f:39775296_39976112 (Chr22)

1-822  (99996-100817)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGTCGGTAGCAGCCCGCTCGGGCCCGTTCGCGCCCGTCCTGTCGGC
        ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 ATTCGGTCGGTCGCAGCCCGCTCGGGCCCGTTCGCGCCCGTCCTGTCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACGTCCCGCGGGGTGGCGGGCGCGCTGCGGCCCTTGGTGCAGGCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100046 CACGTCCCGCGGGGTGGCGGGCGCGCTGCGGCCCTTGGTGCAGGCCACGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCCGCCACCCCGGAGCAGCCTGTGTTGGACCTGAAGCGGCCCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100096 TGCCCGCCACCCCGGAGCAGCCTGTGTTGGACCTGAAGCGGCCCTTCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCCGGGAGTCGCTGAGCGGCCAGGCCGTGCGCCGGCCTTTGGTCGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100146 AGCCGGGAGTCGCTGAGCGGCCAGGCCGTGCGCCGGCCTTTGGTCGCCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTGGGCCTCAATGTCCCTGCTTCTGTTTGTTATTCCCACACAGACATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 100196 CGTGGGCCTCAATGTCCCTGCTTCTGTTTGTTATTCCCACACAGACGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGTGCCTGACTTCTCTGAATACCGCCGCCTTGAAGTTTTAGATAGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100246 AGGTGCCTGACTTCTCTGAATACCGCCGCCTTGAAGTTTTAGATAGTACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGTCTTCAAGAGAAAGCAGCGAGGCTAGGAAAGGTTTCTCCTATTTGGT
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100296 AAGTCTTCAAGAGAAAGCACCGAGGCTAGGAAAGGTTTCTCCTATTTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AACTGGAGTAACTACTGTGGGTGTCGCATATGCTGCCAAGAATGCCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100346 AACTGGAGTAACTACTGTGGGTGTCGCATATGCTGCCAAGAATGCCGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCAGTTCGTTTCCAGCATGAGTGCTTCTGCTGATGTGTTGGCCCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100396 CCCAGTTCGTTTCCAGCATGAGTGCTTCTGCTGATGTGTTGGCCCTGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAAATCGAAATCAAGTTATCTGATATTCCAGAAGGCAAGAACATGGCTTT
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100446 AAAATCGAAATCAAGTTATCCGATATTCCAGAAGGCAAGAACATGGCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAAATGGAGAGGCAAACCCCTGTTTGTGCGTCATAGAACCCAGAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100496 CAAATGGAGAGGCAAACCCCTGTTTGTACGTCATAGAACCCAGAAGGAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGAGCAGGAAGCTGCAGTTGAATTATCACAGTTGAGGGACCCACAGCAT
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100546 TTAAGCAGGAAGCTGCAGTTGAATTATCACAGTTGAGGGACCCACAGCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GATCTAGATCGAGTAAAGAAACCTGAATGGGTTATCCTGATAGGTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100596 GATCTAGATCGAGTAAAGAAACCTGAATGGGTTATCCTGATAGGTGTTTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACTCATCTTGGCTGTGTACCCATTGCAAATGCAGGAGATTTTGGTGGTT
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100646 CACTCATCTTGGTTGTGTACCCATTGCAAATGCAGGAGATTTTGGTGGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATTACTGCCCTTGCCATGGGTCACACTATGATGCATCTGGCAGGATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100696 ATTACTGCCCTTGCCATGGGTCACACTATGATGCATCTGGCAGGATCAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTGGGTCCTGCTCCTCTCAACCTTGAAGTCCCCACGTATGAGTTCACCAG
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100746 TTGGGTCCTGCTACTCTCAACCTTGAAGTCCCCACGTATGAGTTCACCAG

    800     .    :    .    :
    801 TGACGATATGGTGATTGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||
 100796 TGACGATATGGTGATTGTTGGT