seq1 = pF1KE6181.tfa, 375 bp
seq2 = pF1KE6181/gi568815597f_234273719.tfa (gi568815597f:234273719_234483815), 210097 bp

>pF1KE6181 375
>gi568815597f:234273719_234483815 (Chr1)

1-122  (100001-100122)   100% ->
123-282  (100512-100671)   100% ->
283-375  (110005-110097)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCCGGGAGGTCCCTTACTGTCCCCGAGCCGCGGGTTCCTCTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCCGGGAGGTCCCTTACTGTCCCCGAGCCGCGGGTTCCTCTTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAAACGGGGTGGCACTCCAATCGCCTGCTTGGTGATTGTGGCCCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAAACGGGGTGGCACTCCAATCGCCTGCTTGGTGATTGTGGCCCCCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACCTGTTTCTACAGCGCTTAG         CTTCATCGCAGTAGGAATG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100101 CACCTGTTTCTACAGCGCTTAGGTT...CAGCTTCATCGCAGTAGGAATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGCCCCATCTATGAAGGAAAGACAGGTCTGCTGGGGGGCCCGGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100531 GCAGCCCCATCTATGAAGGAAAGACAGGTCTGCTGGGGGGCCCGGGATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTACTGGAAGTGTTTAGATGAGAACTTAGAGGATGCTTCTCAATGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100581 GTACTGGAAGTGTTTAGATGAGAACTTAGAGGATGCTTCTCAATGCAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTTAAGAAGCTCTTTCGAATCAAGTTGTCCCCAACAGTGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100631 AGTTAAGAAGCTCTTTCGAATCAAGTTGTCCCCAACAGTGGGTA...CAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATAAAATATTTTGATAAAAGAAGAGACTACTTAAAATTCAAAGAAAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110005 ATAAAATATTTTGATAAAAGAAGAGACTACTTAAAATTCAAAGAAAAATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGAAGCAGGACAATTTGAGCCTTCAGAAACAACTGCAAAATCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110055 TGAAGCAGGACAATTTGAGCCTTCAGAAACAACTGCAAAATCC