seq1 = pF1KE6175.tfa, 333 bp
seq2 = pF1KE6175/gi568815590r_96131058.tfa (gi568815590r:96131058_96333228), 202171 bp

>pF1KE6175 333
>gi568815590r:96131058_96333228 (Chr8)

(complement)

1-19  (97699-97717)   100% ->
20-91  (100002-100073)   100% ->
92-258  (101289-101455)   100% ->
259-333  (102097-102171)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGGTAAGCAGGCCG         TTTCAGCATCAGGCAAGTGGCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  97699 ATGGCTGGTAAGCAGGCCGGTA...CAGTTTCAGCATCAGGCAAGTGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGATGGTATTCGAAAATGGTATTACAATGCTGCAGGATTCAATAAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100024 GGATGGTATTCGAAAATGGTATTACAATGCTGCAGGATTCAATAAACTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92          GGTTAATGCGAGATGATACAATATACGAGGATGAAGATGTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100074 GTA...TAGGGTTAATGCGAGATGATACAATATACGAGGATGAAGATGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAAGAAGCCATAAGAAGACTTCCTGAGAACCTTTATAATGACAGGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101330 AAAGAAGCCATAAGAAGACTTCCTGAGAACCTTTATAATGACAGGATGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCGCATTAAGAGGGCACTGGACCTGAACTTGAAGCATCAGATCTTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101380 TCGCATTAAGAGGGCACTGGACCTGAACTTGAAGCATCAGATCTTGCCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGAGCAGTGGACCAAATATGAAGAG         GAAAATTTCTACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101430 AAGAGCAGTGGACCAAATATGAAGAGGTA...TAGGAAAATTTCTACCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAACCGTATCTGAAAGAGGTTATTCGGGAAAGAAAAGAAAGAGAAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102112 GAACCGTATCTGAAAGAGGTTATTCGGGAAAGAAAAGAAAGAGAAGAATG

    350     .    :
    324 GGCAAAGAAG
        ||||||||||
 102162 GGCAAAGAAG