seq1 = pF1KE6173.tfa, 243 bp
seq2 = pF1KE6173/gi568815593f_172883861.tfa (gi568815593f:172883861_173120328), 236468 bp

>pF1KE6173 243
>gi568815593f:172883861_173120328 (Chr5)

1-104  (100001-100104)   100% ->
105-152  (110915-110962)   100% ->
153-243  (136378-136468)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTATCACGGCCTCACTGTGCCTCTCATTGTGATGAGCGTGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTATCACGGCCTCACTGTGCCTCTCATTGTGATGAGCGTGTTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCTTCGTCGGCTTCTTGGTGCCTTGGTTCATCCCTAAGGGTCCTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCTTCGTCGGCTTCTTGGTGCCTTGGTTCATCCCTAAGGGTCCTAACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGG         AGTTATCATTACCATGTTGGTGACCTGTTCAGTTTGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGGGTA...TAGAGTTATCATTACCATGTTGGTGACCTGTTCAGTTTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCTATCTCTT         TTGGCTGATTGCAATTCTGGCCCAACTCAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 110952 TGCTATCTCTTGTA...TAGTTGGCTGATTGCAATTCTGGCCCAACTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCCTCTCTTTGGACCGCAATTGAAAAATGAAACCATCTGGTATCTGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136408 CCCTCTCTTTGGACCGCAATTGAAAAATGAAACCATCTGGTATCTGAAGT

    250     .    :
    233 ATCATTGGCCT
        |||||||||||
 136458 ATCATTGGCCT