seq1 = pF1KE6172.tfa, 246 bp
seq2 = pF1KE6172/gi568815593f_132766882.tfa (gi568815593f:132766882_132967579), 200698 bp

>pF1KE6172 246
>gi568815593f:132766882_132967579 (Chr5)

1-154  (100001-100154)   100% ->
155-246  (100607-100698)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCGCGAGTTTGGGAATCTGACGCGGATGCGGCATGTGATCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCGCGAGTTTGGGAATCTGACGCGGATGCGGCATGTGATCAGCTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCTTGTCACCGTTCGAGCAGCGCGCCTATCCGCACGTCTTCACTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCTTGTCACCGTTCGAGCAGCGCGCCTATCCGCACGTCTTCACTAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAATCCCCAATGTTCTGCGCCGCATTCGGGAGTCTTTCTTTCGCGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAATCCCCAATGTTCTGCGCCGCATTCGGGAGTCTTTCTTTCGCGTGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGC         AGTTTGTAGTGTTTTATCTTATCTACACATGGGGGAC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGCGTG...AAGAGTTTGTAGTGTTTTATCTTATCTACACATGGGGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAAGAGTTCGAGAGATCCAAGAGGAAGAATCCAGCTGCCTATGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100644 TGAAGAGTTCGAGAGATCCAAGAGGAAGAATCCAGCTGCCTATGAAAATG

    250     .
    242 ACAAA
        |||||
 100694 ACAAA