seq1 = pF1KE6167.tfa, 402 bp
seq2 = pF1KE6167/gi568815597f_9897259.tfa (gi568815597f:9897259_10115829), 218571 bp

>pF1KE6167 402
>gi568815597f:9897259_10115829 (Chr1)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-252  (110312-110490)   100% ->
253-354  (110915-111016)   100% ->
355-402  (118524-118571)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGCCGACCTCAGCGGTACTTGGACCCTGCTCAGCAGCGACAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGCCGACCTCAGCGGTACTTGGACCCTGCTCAGCAGCGACAACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGGGCTACATGCTGGCCCTAG         GTATTGACTTTGCCACTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 CGAGGGCTACATGCTGGCCCTAGGTA...AAGGTATTGACTTTGCCACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTAAAATAGCCAAGTTGCTGAAGCCACAGAAAGTGATTGAGCAGAATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110330 GTAAAATAGCCAAGTTGCTGAAGCCACAGAAAGTGATTGAGCAGAATGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATTCTTTTACCATCCACACGAACAGCAGCCTAAGGAACTACTTTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110380 GATTCTTTTACCATCCACACGAACAGCAGCCTAAGGAACTACTTTGTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTTAAAGTTGGAGAAGAATTTGATGAAGATAACAGAGGCCTGGACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110430 ATTTAAAGTTGGAGAAGAATTTGATGAAGATAACAGAGGCCTGGACAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAAAATGCAAG         AGTTTGGTTATCTGGGACAATGACAGGCTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 110480 GAAAATGCAAGGTA...CAGAGTTTGGTTATCTGGGACAATGACAGGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCTGTATCCAGAAGGGAGAAAAGAAGAACAGAGGCTGGACCCATTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110945 ACCTGTATCCAGAAGGGAGAAAAGAAGAACAGAGGCTGGACCCATTGGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGAAGGAGACAAACTCCACCTG         GAAATGTTCTGTGAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110995 CGAAGGAGACAAACTCCACCTGGTA...TAGGAAATGTTCTGTGAAGGTC

    400     .    :    .    :    .
    374 AAGTGTGCAAACAGACATTCCAGAGAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 118543 AAGTGTGCAAACAGACATTCCAGAGAGCC