seq1 = pF1KE6149.tfa, 435 bp
seq2 = pF1KE6149/gi568815590f_103040898.tfa (gi568815590f:103040898_103328096), 287199 bp

>pF1KE6149 435
>gi568815590f:103040898_103328096 (Chr8)

1-160  (100001-100160)   99% ->
161-327  (172022-172188)   100% ->
328-435  (187092-187199)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTGCGGTGGGAGCCGGGCGGATGCCATCGAGCCCCGCTACTACGA
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCTGCGGCGGGAGCCGGGCGGATGCCATCGAGCCCCGCTACTACGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCTGGACCCGGGAGACAGAATCCACCTGGCTCACCTACACCGACTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCTGGACCCGGGAGACAGAATCCACCTGGCTCACCTACACCGACTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGCGCCGCCCAGCGCCGCCGCCCCGGACAGCGGCCCCGAAGCGGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGCGCCGCCCAGCGCCGCCGCCCCGGACAGCGGCCCCGAAGCGGGCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCACTCGG         GCATGCTGGAAGATGGACTGCCCTCCAATGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCACTCGGGTA...CAGGCATGCTGGAAGATGGACTGCCCTCCAATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTGCCCCGATCTACAGCCCCAGGTGGAATACCCAACCCAGAGAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172053 TGTGCCCCGATCTACAGCCCCAGGTGGAATACCCAACCCAGAGAAGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CGAACTGTGAGACCCAGTGCCCAAATCCCCAGAGCCTCAGCTCAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172103 CGAACTGTGAGACCCAGTGCCCAAATCCCCAGAGCCTCAGCTCAGGCCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGACCCAGAAACAGAATGGCCTTCAGACCACAGAG         GCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 172153 CTGACCCAGAAACAGAATGGCCTTCAGACCACAGAGGTA...CAGGCTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAGAGATGCTAAGAGAATGCCTGCAAAAGAAGTCACCATTAATGTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187097 AAGAGATGCTAAGAGAATGCCTGCAAAAGAAGTCACCATTAATGTAACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATAGCATCCAACAGATGGACAGAAGTCGAAGAATCACAAAGAACTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187147 ATAGCATCCAACAGATGGACAGAAGTCGAAGAATCACAAAGAACTGTGTC

    450 
    433 AAC
        |||
 187197 AAC