seq1 = pF1KE6138.tfa, 405 bp
seq2 = pF1KE6138/gi568815583r_82436804.tfa (gi568815583r:82436804_82640133), 203330 bp

>pF1KE6138 405
>gi568815583r:82436804_82640133 (Chr15)

(complement)

1-155  (100000-100153)   99% ->
156-261  (101149-101254)   100% ->
262-327  (101763-101828)   100% ->
328-405  (103253-103330)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCGCGTTCGCACCAAAACCGTGAAGAAGGCGGCCCGGGTCATCAT
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGGCCGCGTTCGCACCAAAACCGTGAAGAAGGCGGCCCGGGTCATCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAAAAGTACTACACGCGCCTGGGCAACGACTTCCACACGAACAAGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 AGAAAAGTACTACACGCGCCTGGGCAACGACTTCCACACGAACAAGCGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTGCGAGGAGATCGCCATTATCCCCAGCAAAAAGCTCCGCAACAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 TGTGCGAGGAGATCGCCATTATCCCCAGCAAAAAGCTCCGCAACAAGATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGG         TTATGTCACGCATCTGATGAAGCGAATTCAGAGAGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 GCAGGGTG...TAGTTATGTCACGCATCTGATGAAGCGAATTCAGAGAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCAGTAAGAGGTATCTCCATCAAGCTGCAGGAGGAGGAGAGAGAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101185 CCCAGTAAGAGGTATCTCCATCAAGCTGCAGGAGGAGGAGAGAGAAAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAGACAATTATGTTCCTGAG         GTCTCAGCCTTGGATCAGGAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101235 GAGACAATTATGTTCCTGAGGTA...TAGGTCTCAGCCTTGGATCAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATTATTGAAGTAGATCCTGACACTAAGGAAATGCTGAAGCTTTTG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101784 ATTATTGAAGTAGATCCTGACACTAAGGAAATGCTGAAGCTTTTGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     GACTTCGGCAGTCTGTCCAACCTTCAGGTCACTCAGCCTACAGTTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101834 .CAGGACTTCGGCAGTCTGTCCAACCTTCAGGTCACTCAGCCTACAGTTG

    400     .    :    .    :    .    :
    374 GGATGAATTTCAAAACGCCTCGGGGACCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 103299 GGATGAATTTCAAAACGCCTCGGGGACCTGTT