seq1 = pF1KE6138.tfa, 405 bp
seq2 = pF1KE6138/gi568815576f_31939493.tfa (gi568815576f:31939493_32139893), 200401 bp

>pF1KE6138 405
>gi568815576f:31939493_32139893 (Chr22)

1-405  (99997-100401)   96%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCGCGTTCGCACCAAAACCGTGAAGAAGGCGGCCCGGGTCATCAT
        ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 ATGTGCCGCGTTTGCACCAAAACCGTGAAGAAGGCGGCCCGGGTCATCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAAAAGTACTACACGCGCCTGGGCAACGACTTCCACACGAACAAGCGCG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100047 AGAAAAGTACTACACACGCCTGGGCAACGACTTCCACACGAACAAGCGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTGCGAGGAGATCGCCATTATCCCCAGCAAAAAGCTCCGCAACAAGATA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100097 TGTGCAAGGAGATCGCCATTATCCCCAGCAAGAAGCTCCGCAACAAGATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCAGGTTATGTCACGCATCTGATGAAGCGAATTCAGAGAGGCCCAGTAAG
        ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||
 100147 GCAGGCTATGTCACGCATCTGATGAAATGGATTCAGAGAGGCCCAGTAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGTATCTCCATCAAGCTGCAGGAGGAGGAGAGAGAAAGGAGAGACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100197 AGGTATCTCCATCAAGCTGCAGGAGGAGGAGAGAGAAAGGAGAGACAATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGTTCCTGAGGTCTCAGCCTTGGATCAGGAGATTATTGAAGTAGATCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100247 ATGTTCCTGAGGTCTCAGCCTTGGATCAGGAGATAATTGAAGTAGATCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACACTAAGGAAATGCTGAAGCTTTTGGACTTCGGCAGTCTGTCCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100297 GACACTAAGGAAATGCTGAAGCTTTTGGACTTCGGCAGTCTGTCCAACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCAGGTCACTCAGCCTACAGTTGGGATGAATTTCAAAACGCCTCGGGGAC
         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
 100347 GCAGGTCACTCAGCCTACAGTTGGGATGAACTTCAAAATGCCTCGGGGAC

    400     .
    401 CTGTT
        |||||
 100397 CTGTT