seq1 = pF1KE6128.tfa, 426 bp
seq2 = pF1KE6128/gi568815576f_38581979.tfa (gi568815576f:38581979_38783838), 201860 bp

>pF1KE6128 426
>gi568815576f:38581979_38783838 (Chr22)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-236  (100345-100463)   100% ->
237-354  (100901-101018)   100% ->
355-426  (101789-101860)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCCGCCGTCGCTGCTGCCGGTGCAGGGGAACCCCAGTCCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCCGCCGTCGCTGCTGCCGGTGCAGGGGAACCCCAGTCCCCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAATTGCTCCCGAAAGGCGACGCGGAGAAGCCTGAGGAGGAGCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAATTGCTCCCGAAAGGCGACGCGGAGAAGCCTGAGGAGGAGCTGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGACGACGATGAGGAG         CTAGATGAGACCCTGTCGGAGAGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGACGACGATGAGGAGGTA...CAGCTAGATGAGACCCTGTCGGAGAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTATGGGGCCTGACGGAGATGTTTCCGGAGAGGGTCCGGTCCGCGGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100369 CTATGGGGCCTGACGGAGATGTTTCCGGAGAGGGTCCGGTCCGCGGCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGCCACTTTTGATCTTTCCCTCTTTGTGGCTCAGAAAATGTACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100419 AGCCACTTTTGATCTTTCCCTCTTTGTGGCTCAGAAAATGTACAGGTA..

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    237     GTTTTCCAGGGCAGCCTTGTGGATTGGGACCACTTCCTTTATGATC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100469 .CAGGTTTTCCAGGGCAGCCTTGTGGATTGGGACCACTTCCTTTATGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGTTCTTCCCGTTGTCTTTGAGACGGAGAAGTTGCAAATGGAGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100947 CTGGTTCTTCCCGTTGTCTTTGAGACGGAGAAGTTGCAAATGGAGCAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCAGCAACTGCAGCAGCGGCAG         ATACTTCTAGGACCTAACA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100997 GCAGCAACTGCAGCAGCGGCAGGTG...CAGATACTTCTAGGACCTAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGGGCTCTCAGGAGGAATGCCAGGGGCTCTACCCTCACTTCCTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101808 CAGGGCTCTCAGGAGGAATGCCAGGGGCTCTACCCTCACTTCCTGGAAAG

    450 
    424 ATC
        |||
 101858 ATC