seq1 = pF1KE6101.tfa, 309 bp
seq2 = pF1KE6101/gi568815587f_118301666.tfa (gi568815587f:118301666_118509095), 207430 bp

>pF1KE6101 309
>gi568815587f:118301666_118509095 (Chr11)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-213  (105272-105432)   100% ->
214-309  (107335-107430)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAATTTGTCCGTAACCTTGTGGAGAAGACCCCGGCGCTGGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCAATTTGTCCGTAACCTTGTGGAGAAGACCCCGGCGCTGGTGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CG         CTGCTGTGACTTACTCGAAGCCTCGATTGGCCACATTTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGTG...CAGCTGCTGTGACTTACTCGAAGCCTCGATTGGCCACATTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGTACTACGCCAAGGTTGAGCTGGTTCCTCCCACCCCTGCTGAGATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105311 GGTACTACGCCAAGGTTGAGCTGGTTCCTCCCACCCCTGCTGAGATCCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGAGCTATTCAGAGCCTGAAAAAAATAGTCAATAGTGCTCAGACTGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105361 AGAGCTATTCAGAGCCTGAAAAAAATAGTCAATAGTGCTCAGACTGGTAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCAAACAGCTCACAGTTAAG         GAAGCTGTGCTGAATGGTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105411 CTTCAAACAGCTCACAGTTAAGGTA...CAGGAAGCTGTGCTGAATGGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGTGGCCACTGAGGTGTTGATGTGGTTTTATGTCGGAGAGATTATAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107354 TGGTGGCCACTGAGGTGTTGATGTGGTTTTATGTCGGAGAGATTATAGGC

    300     .    :    .    :    .
    283 AAGCGGGGCATCATTGGCTATGATGTT
        |||||||||||||||||||||||||||
 107404 AAGCGGGGCATCATTGGCTATGATGTT