seq1 = pF1KE6096.tfa, 978 bp
seq2 = pF1KE6096/gi568815597r_158478922.tfa (gi568815597r:158478922_158679899), 200978 bp

>pF1KE6096 978
>gi568815597r:158478922_158679899 (Chr1)

(complement)

1-978  (100001-100978)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGTTGAATGTTTATTGTTGTTTCTTTCAAATTTCAGACATTCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGTTGAATGTTTATTGTTGTTTCTTTCAAATTTCAGACATTCAAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGAAGATCAACCAGACAATCCTGAAGGAATTCATTCTTGTTGGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGAAGATCAACCAGACAATCCTGAAGGAATTCATTCTTGTTGGCTTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGTGTACCCACATGTACAGACATTTCTTTTTGTGGTCTTCTTTTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGTGTACCCACATGTACAGACATTTCTTTTTGTGGTCTTCTTTTGTCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACCTTCTCACCCTTGCAGGTAATCTGATCATCATGGGTCTAACTTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACCTTCTCACCCTTGCAGGTAATCTGATCATCATGGGTCTAACTTGGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACAGGTCCCTCCACACCCCTATGTATCTCTTCCTTAGTGCACTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACAGGTCCCTCCACACCCCTATGTATCTCTTCCTTAGTGCACTCTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTCTGAGACCTGCTATACGCTGACCATCGTCCCCAAGATGCTGGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTCTGAGACCTGCTATACGCTGACCATCGTCCCCAAGATGCTGGAAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTACTGGCCAAGGACAGAAGCATTTCAGTCACAGGTTGTAGCTTACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTACTGGCCAAGGACAGAAGCATTTCAGTCACAGGTTGTAGCTTACAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTGCTTCTTCTTGGGACTTGGTGGCACAAACTGTATCATTCTCACTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTGCTTCTTCTTGGGACTTGGTGGCACAAACTGTATCATTCTCACTTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGGATATGACCGCTTCCTGGCCATCTGTAACCCTCTAAGATATCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGGATATGACCGCTTCCTGGCCATCTGTAACCCTCTAAGATATCCACTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTTATGACCAACATTGTATGTGGACAACTTGTGGCCTCTGCTTGCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTTATGACCAACATTGTATGTGGACAACTTGTGGCCTCTGCTTGCACTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGGCTTCTTTATCTCTCTTACAGAGACTGCACTGATATTCAGGGACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGGCTTCTTTATCTCTCTTACAGAGACTGCACTGATATTCAGGGACTCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTGCAGACCCAACCTTGTCAAACACTTCTTCTGCCATATGCTGGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTGCAGACCCAACCTTGTCAAACACTTCTTCTGCCATATGCTGGCAGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTAGGCTGTCTTGTATAGACAGTAACCACACAGAATTCATTATAACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTAGGCTGTCTTGTATAGACAGTAACCACACAGAATTCATTATAACACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GATCTCAGTGTCTGGTTTGCTGGGTACCCTTCTGCTCATCATCCTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GATCTCAGTGTCTGGTTTGCTGGGTACCCTTCTGCTCATCATCCTGACTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGTCTTCATTATTTCTACTGTCCTCAGGATCCCTTCAGCTGAGGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGTCTTCATTATTTCTACTGTCCTCAGGATCCCTTCAGCTGAGGGCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGAAGGCCTTCACCACCTGTGCCTCCCACCTCACCGTGGTTATAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGAAGGCCTTCACCACCTGTGCCTCCCACCTCACCGTGGTTATAATCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTTTGGTTTTGCATCTATTGTTTATTTGAAGCCAGAAGCCTCAGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTTTGGTTTTGCATCTATTGTTTATTTGAAGCCAGAAGCCTCAGGAGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACACACTCATAGCAGTCCCTTATACTGTCATTACCCCCTTCCTCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACACACTCATAGCAGTCCCTTATACTGTCATTACCCCCTTCCTCAGCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATCATATTCAGCCTGAGGAATAAGGACATGAAAAATGCTTTTAGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATCATATTCAGCCTGAGGAATAAGGACATGAAAAATGCTTTTAGAAGAAT

    950     .    :    .    :    .
    951 GATGGGAAACACAGTTGCCTTGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GATGGGAAACACAGTTGCCTTGAAAAAA