seq1 = pF1KE6054.tfa, 957 bp
seq2 = pF1KE6054/gi568815587f_56246039.tfa (gi568815587f:56246039_56446995), 200957 bp

>pF1KE6054 957
>gi568815587f:56246039_56446995 (Chr11)

1-957  (100001-100957)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATCATGTGGTAAAACACAATCACACGGCAGTGACCAAGGTGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATCATGTGGTAAAACACAATCACACGGCAGTGACCAAGGTGACTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTTATTCTCATGGGGATTACAGACAACCCTGGGCTGCAGGCTCCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATTTATTCTCATGGGGATTACAGACAACCCTGGGCTGCAGGCTCCACTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGGACTCTTCCTCATCATATATCTGGTCACAGTGATAGGCAATCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGGACTCTTCCTCATCATATATCTGGTCACAGTGATAGGCAATCTGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGTTATCTTGACCTACTTGGACTCCAAGCTACACACCCCCATGTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGGTTATCTTGACCTACTTGGACTCCAAGCTACACACCCCCATGTACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTCCTTAGACATTTGTCAATCACTGATCTTGGTTACTCCACTGTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTCCTTAGACATTTGTCAATCACTGATCTTGGTTACTCCACTGTCATTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCCGAAGATGTTAGTAAACTTCATAGTGCACAAAAACACAATTTCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCCGAAGATGTTAGTAAACTTCATAGTGCACAAAAACACAATTTCTTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATTGGTATGCCACTCAGCTAGCATTCTTTGAGATTTTCATCATCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AATTGGTATGCCACTCAGCTAGCATTCTTTGAGATTTTCATCATCTCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTCTTTATTCTATCAGCAATGGCCTATGATCGCTACGTAGCCATCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTCTTTATTCTATCAGCAATGGCCTATGATCGCTACGTAGCCATCTGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AACCTCTTCTGTACGTGATCATCATGGCAGAGAAAGTACTTTGGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AACCTCTTCTGTACGTGATCATCATGGCAGAGAAAGTACTTTGGGTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTAATTGTTCCCTATCTCTATAGCACGTTTGTGTCACTATTTCTCACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTAATTGTTCCCTATCTCTATAGCACGTTTGTGTCACTATTTCTCACAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TAAGTTATTTAAACTGTCCTTCTGTGGCTCAAACATAATCAGCTATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TAAGTTATTTAAACTGTCCTTCTGTGGCTCAAACATAATCAGCTATTTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTGTGACTGTATCCCTCTGATGTCCATACTCTGTTCTGACACAAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTGTGACTGTATCCCTCTGATGTCCATACTCTGTTCTGACACAAATGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTAGAATTAATAATTTTGATCTTCTCAGGCTGTAATTTGCTCTTCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTAGAATTAATAATTTTGATCTTCTCAGGCTGTAATTTGCTCTTCTCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCAATTGTTCTCATATCCTACATGTTTATTCTAGTGGCCATTCTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCAATTGTTCTCATATCCTACATGTTTATTCTAGTGGCCATTCTCAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAACTCAAGGAAAGGGAGGTACAAAGCCTTCTCCACCTGTAGCTCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAACTCAAGGAAAGGGAGGTACAAAGCCTTCTCCACCTGTAGCTCTCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGACAGTGGTGATCATGTTCTATGGGACATTGTTATTTATTTACTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGACAGTGGTGATCATGTTCTATGGGACATTGTTATTTATTTACTTGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACCCAAGTCCAGTCATACTTTGGCTATTGATAAAATGGCCTCAGTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ACCCAAGTCCAGTCATACTTTGGCTATTGATAAAATGGCCTCAGTGTTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATACCCTGTTGATTCCTATGCTGAATCCGTTGATCTACAGCCTAAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATACCCTGTTGATTCCTATGCTGAATCCGTTGATCTACAGCCTAAGGAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAAGAAGTAAAAGATGCTCTAAAGAGAACTTTAACCAATCGATTCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAAGAAGTAAAAGATGCTCTAAAGAGAACTTTAACCAATCGATTCAAAAT

    950     .
    951 TCCCATT
        |||||||
 100951 TCCCATT