seq1 = pF1KE6053.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KE6053/gi568815591f_144009583.tfa (gi568815591f:144009583_144210536), 200954 bp

>pF1KE6053 954
>gi568815591f:144009583_144210536 (Chr7)

1-954  (100001-100954)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGGCAACCAGACATGGATCACAGACATCACCCTGCTGGGATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGGCAACCAGACATGGATCACAGACATCACCCTGCTGGGATTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTTGGTCCAGCACTGGCGATTCTCCTCTGTGGACTCTTCTCTGTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTTGGTCCAGCACTGGCGATTCTCCTCTGTGGACTCTTCTCTGTCTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATACACTCACCCTGCTGGGGAATGGGGTCATCTTTGGGATTATCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATACACTCACCCTGCTGGGGAATGGGGTCATCTTTGGGATTATCTGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTCTAAGCTTCACACACCCATGTACTTCTTCCTCTCACACCTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTCTAAGCTTCACACACCCATGTACTTCTTCCTCTCACACCTGGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATTGACATGTCCTATGCTTCCAACAATGTTCCCAAGATGTTGGCAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATTGACATGTCCTATGCTTCCAACAATGTTCCCAAGATGTTGGCAAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAATGAACCAGAAAAGAACCATCTCCTTTGTTCCATGCATAATGCAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAATGAACCAGAAAAGAACCATCTCCTTTGTTCCATGCATAATGCAGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTTTGTATTTGGCTTTTGCTGTTACAGAGTGCCTGATTTTGGTGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTTTGTATTTGGCTTTTGCTGTTACAGAGTGCCTGATTTTGGTGGTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCCTATGATAGGTATGTGGCCATCTGCCACCCTTTCCAGTACACTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTCCTATGATAGGTATGTGGCCATCTGCCACCCTTTCCAGTACACTGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATGAGCTGGAGAGTGTGCACGATCCTGGTTCTCACGTCCTGGTCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATGAGCTGGAGAGTGTGCACGATCCTGGTTCTCACGTCCTGGTCATGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGTTTGCCCTGTCCCTGGTACATGAAATTCTCCTTCTAAGGTTGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGTTTGCCCTGTCCCTGGTACATGAAATTCTCCTTCTAAGGTTGCCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGTGGGCCCCGGGATGTGAACCACCTCTTCTGTGAAATTCTGTCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGTGGGCCCCGGGATGTGAACCACCTCTTCTGTGAAATTCTGTCTGTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAAGCTGGCCTGTGCTGACACCTGGGTTAACCAAGTGGTCATATTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAAGCTGGCCTGTGCTGACACCTGGGTTAACCAAGTGGTCATATTTGCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCTGTGTGTTTGTCTTAGTCGGGCCTCTTTCCTTGATTCTGGTCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCTGTGTGTTTGTCTTAGTCGGGCCTCTTTCCTTGATTCTGGTCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATGCACATCCTCGGGGCCATCCTGAAGATCCAGACAAAGGAGGGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATGCACATCCTCGGGGCCATCCTGAAGATCCAGACAAAGGAGGGCCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TAAAGGCCTTCTCCACCTGCTCCTCCCACCTGTGTGTGGTTGGACTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TAAAGGCCTTCTCCACCTGCTCCTCCCACCTGTGTGTGGTTGGACTATTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTGGCATAGCCATGGTGGTTTACATGGTCCCAGACTCTAATCAACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGGCATAGCCATGGTGGTTTACATGGTCCCAGACTCTAATCAACGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAGCAGGAGAAAATGCTGTCCCTGTTTCACAGTGTCTTTAATCCAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAGCAGGAGAAAATGCTGTCCCTGTTTCACAGTGTCTTTAATCCAATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAACCCCCTGATCTACAGCCTGAGGAATGCTCAGTTGAAGGGCGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAACCCCCTGATCTACAGCCTGAGGAATGCTCAGTTGAAGGGCGCCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CACAGAGCACTCCAGAGGAAGAGGTCCATGAGAACGGTGTATGGGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CACAGAGCACTCCAGAGGAAGAGGTCCATGAGAACGGTGTATGGGCTTTG

    950 
    951 CCTT
        ||||
 100951 CCTT