seq1 = pF1KE6030.tfa, 948 bp
seq2 = pF1KE6030/gi568815579f_15849008.tfa (gi568815579f:15849008_16049955), 200948 bp

>pF1KE6030 948
>gi568815579f:15849008_16049955 (Chr19)

1-948  (100001-100948)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTAGTCAGAACTATAGCATCATATCTGAATTTAACCTCTTTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTAGTCAGAACTATAGCATCATATCTGAATTTAACCTCTTTGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAGCCTTCCCCCAGCACCTCCTGCCCATCTTGTTCCTGCTGTACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCAGCCTTCCCCCAGCACCTCCTGCCCATCTTGTTCCTGCTGTACCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATGTTCCTGTTCACATTGCTGGGCAACCTTCTCATCATGGCCACAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGATGTTCCTGTTCACATTGCTGGGCAACCTTCTCATCATGGCCACAATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGATTGAACACAGACTCCACACACCCATGTACCTCTTCTTGTGCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGATTGAACACAGACTCCACACACCCATGTACCTCTTCTTGTGCACCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCGTCTCTGAGATTCTGTTCACTGTTGCCATCACCCCTCGCATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCGTCTCTGAGATTCTGTTCACTGTTGCCATCACCCCTCGCATGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGATCTGCTTTCCACCCATCATTCCATCACCTTTGTGGCTTGTGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGATCTGCTTTCCACCCATCATTCCATCACCTTTGTGGCTTGTGCCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGATGTTCTTCTCCTTCATGTTTGGCTTCACTCACTCCTTCCTTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGATGTTCTTCTCCTTCATGTTTGGCTTCACTCACTCCTTCCTTCTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTCATGGGCTATGATCGCTATGTGGCCATCTGCCACCCACTGCGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTCATGGGCTATGATCGCTATGTGGCCATCTGCCACCCACTGCGTTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGTGCTCATGAGCCCCCGTGACTGTGCCCATCTTGTGGCCTGTACCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGTGCTCATGAGCCCCCGTGACTGTGCCCATCTTGTGGCCTGTACCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGGTGGCTCAGTCATGGGGATGATGGTGACAACGATAGTTTTCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTGGTGGCTCAGTCATGGGGATGATGGTGACAACGATAGTTTTCCACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACTTTCTGTGGGTCTAATGTGATCCACCATTTTTTCTGTCATGTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACTTTCTGTGGGTCTAATGTGATCCACCATTTTTTCTGTCATGTGCTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCTCTTGAAGTTGGCCTGTGAAAACAAGACATCATCTGTCATCATGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCTCTTGAAGTTGGCCTGTGAAAACAAGACATCATCTGTCATCATGGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGATGCTGGTGTGTGTCACAGCCCTGATAGGCTGTTTATTCCTCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGATGCTGGTGTGTGTCACAGCCCTGATAGGCTGTTTATTCCTCATCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTCTCCTATGTCTTCATTGTGGCTGCCATCTTGAGGATTCCCTCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTCTCCTATGTCTTCATTGTGGCTGCCATCTTGAGGATTCCCTCTGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAGGCCGGCACAAGACATTTTCTACGTGTGTATCCCACCTCACTGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGGCCGGCACAAGACATTTTCTACGTGTGTATCCCACCTCACTGTGGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTCACGCACTATAGTTTTGCCTCCTTTATCTACCTCAAGCCCAAGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTCACGCACTATAGTTTTGCCTCCTTTATCTACCTCAAGCCCAAGGGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCATTCTATGTACAGTGACGCCTTGATGGCCACCACCTATACTGTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCATTCTATGTACAGTGACGCCTTGATGGCCACCACCTATACTGTCTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCCCTTCCTTAGCCCAATCATTTTCAGCCTAAGGAACAAGGAGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCCCCTTCCTTAGCCCAATCATTTTCAGCCTAAGGAACAAGGAGCTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    901 AATGCCATAAATAAAAACTTTTACAGAAAATTCTGTCCTCCAAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AATGCCATAAATAAAAACTTTTACAGAAAATTCTGTCCTCCAAGTTCC