seq1 = pF1KE6015.tfa, 945 bp
seq2 = pF1KE6015/gi568815587r_56036774.tfa (gi568815587r:56036774_56237718), 200945 bp

>pF1KE6015 945
>gi568815587r:56036774_56237718 (Chr11)

(complement)

1-945  (100001-100945)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCCTGAAAATTTCACCAGGGTCACTGAGTTTATTCTCACAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCCTGAAAATTTCACCAGGGTCACTGAGTTTATTCTCACAGGTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCTAGCTGTCCAGAGCTCCAGATTCCCCTCTTCCTGGTCTTCCTAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCTAGCTGTCCAGAGCTCCAGATTCCCCTCTTCCTGGTCTTCCTAGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATGTGCTGACCATGGCAGGGAACCTGGGCATCATCACCCTCACCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATGTGCTGACCATGGCAGGGAACCTGGGCATCATCACCCTCACCAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTGACTCTCGACTTCAAAACCCCATGTACTTTTTCCTGAGACATCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTTGACTCTCGACTTCAAAACCCCATGTACTTTTTCCTGAGACATCTAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TATCATCAATCTTGGCAACTCTACTGTCATTGCCCCTAAAATGCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TATCATCAATCTTGGCAACTCTACTGTCATTGCCCCTAAAATGCTGATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTTTTAGTAAAGAAGAAAACTACCTCATTCTATGAATGTGCCACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTTTTAGTAAAGAAGAAAACTACCTCATTCTATGAATGTGCCACCCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGGAGGGTTCTTGTTCTTTATTGTATCGGAGGTAATGATGCTGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGGAGGGTTCTTGTTCTTTATTGTATCGGAGGTAATGATGCTGGCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTATGACCGCTATGTGGCCATTTGTAACCCTCTGCTCTACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTATGACCGCTATGTGGCCATTTGTAACCCTCTGCTCTACATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGTGGTGTCTCGGCGGCTCTGCCTCCTGCTGGTGTCCCTCACATACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGTGGTGTCTCGGCGGCTCTGCCTCCTGCTGGTGTCCCTCACATACCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TATGGCTTTTCTACAGCTATTGTGGTTTCACCTTGTATATTCTCTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TATGGCTTTTCTACAGCTATTGTGGTTTCACCTTGTATATTCTCTGTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTATTGCTCTTCTAATATAATCAATCATTTTTACTGTGATATTGCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTATTGCTCTTCTAATATAATCAATCATTTTTACTGTGATATTGCACCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTTAGCATTATCTTGCTCTGATACTTACATACCAGAAACAATAGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTTAGCATTATCTTGCTCTGATACTTACATACCAGAAACAATAGTCTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATATCTGCAGCAACAAATTTGGTTTTTTCCATGATTACAGTTCTAGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATATCTGCAGCAACAAATTTGGTTTTTTCCATGATTACAGTTCTAGTATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTATTTCAATATTGTTTTGTCCATTCTAAGGATACGTTCACCAGAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTATTTCAATATTGTTTTGTCCATTCTAAGGATACGTTCACCAGAAGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAAAAAAGCCTTTTCCACCTGCGCTTCGCATATGATAGCAGTCACGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAAAAAAGCCTTTTCCACCTGCGCTTCGCATATGATAGCAGTCACGGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGGACAATGCTATTTATGTATTTGCAGCCCCAAACCAACCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGGACAATGCTATTTATGTATTTGCAGCCCCAAACCAACCACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACTGGATACTGATAAGATGGCTTCTGTGTTTTACACATTGGTGATTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ACTGGATACTGATAAGATGGCTTCTGTGTTTTACACATTGGTGATTCCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGAATCCCTTGATCTACAGCCTGAGGAATAATGATGTAAATGTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGAATCCCTTGATCTACAGCCTGAGGAATAATGATGTAAATGTTGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    901 TTAAAGAAATTCATGGAAAATCCATGTTACTCCTTTAAATCAATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTAAAGAAATTCATGGAAAATCCATGTTACTCCTTTAAATCAATG