seq1 = pF1KE5994.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KE5994/gi568815587r_58018503.tfa (gi568815587r:58018503_58219444), 200942 bp

>pF1KE5994 942
>gi568815587r:58018503_58219444 (Chr11)

(complement)

1-942  (100001-100942)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAAGAATAATCTCACCAGAGTAACCGAATTCATTCTCATGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAAGAATAATCTCACCAGAGTAACCGAATTCATTCTCATGGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATGGACCACCCCAAATTGGAGATTCCCCTCTTTCTGGTGTTTCTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATGGACCACCCCAAATTGGAGATTCCCCTCTTTCTGGTGTTTCTGAGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACCTAGTCACCCTTCTTGGGAATGTGGGGATGATTATGTTAATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTACCTAGTCACCCTTCTTGGGAATGTGGGGATGATTATGTTAATCCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTAGATGTCAAACTCTACACCCCAATGTACTTCTTCCTGAGCCACCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTAGATGTCAAACTCTACACCCCAATGTACTTCTTCCTGAGCCACCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGCTGGATGCCTGTTACACCTCAGTCATCACCCCTCAGATCCTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGCTGGATGCCTGTTACACCTCAGTCATCACCCCTCAGATCCTAGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CATTGGCCACAGGCAAAACGGTCATCTCCTACGGCCACTGTGCTGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CATTGGCCACAGGCAAAACGGTCATCTCCTACGGCCACTGTGCTGCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTTTTATTCACCATCTGTGCAGGCACAGAGTGCTTTCTGCTGGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTTTTATTCACCATCTGTGCAGGCACAGAGTGCTTTCTGCTGGCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTATGATCGCTATGCTGCCATTCGCAACCCACTGCTCTATACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTATGATCGCTATGCTGCCATTCGCAACCCACTGCTCTATACCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGCCATGAATCCCAGGCTCTGCTGGAGCCTGGTGGTAGGAGCCTATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGCCATGAATCCCAGGCTCTGCTGGAGCCTGGTGGTAGGAGCCTATGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGTGGGGTGTCAGGAGCCATCCTGCGTACCACTTGCACCTTCACCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGTGGGGTGTCAGGAGCCATCCTGCGTACCACTTGCACCTTCACCCTCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTAAGGACAATCAAATAAACTTCTTCTTCTGTGACCTCCCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTAAGGACAATCAAATAAACTTCTTCTTCTGTGACCTCCCACCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTGAAGCTTGCCTGCAGTGACACAGCAAACATCGAGATTGTCATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTGAAGCTTGCCTGCAGTGACACAGCAAACATCGAGATTGTCATCATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCTTTGGCAATTTTGTGATTTTGGCCAATGCCTCCGTCATCCTGATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCTTTGGCAATTTTGTGATTTTGGCCAATGCCTCCGTCATCCTGATTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATCTGCTCATCATCAAGACCATTTTGAAAGTGAAGTCTTCAGGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATCTGCTCATCATCAAGACCATTTTGAAAGTGAAGTCTTCAGGTGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGGCCAAGACTTTCTCCACATGTGCCTCTCACATCACTGCTGTGGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGGCCAAGACTTTCTCCACATGTGCCTCTCACATCACTGCTGTGGCCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTTTGGAGCCCTTATCTTCATGTATCTGCAAAGTGGCTCAGGCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTTTGGAGCCCTTATCTTCATGTATCTGCAAAGTGGCTCAGGCAAATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCTGGAGGAAGACAAAGTCGTGTCTGTCTTCTATACAGTGGTCATCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCTGGAGGAAGACAAAGTCGTGTCTGTCTTCTATACAGTGGTCATCCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGAACCCTCTGATCTACAGCTTAAGAAACAAAGATGTAAAAGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGAACCCTCTGATCTACAGCTTAAGAAACAAAGATGTAAAAGACGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCAGAAAGGTCGCTAGGAGACTCCAGGTGTCCCTGAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCAGAAAGGTCGCTAGGAGACTCCAGGTGTCCCTGAGCATG