seq1 = pF1KE5992.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KE5992/gi568815587r_55835459.tfa (gi568815587r:55835459_56036400), 200942 bp

>pF1KE5992 942
>gi568815587r:55835459_56036400 (Chr11)

(complement)

1-942  (100001-100942)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAATTTACAGATAGAAACTACACGTTGGTCACTGAGTTTATTCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAATTTACAGATAGAAACTACACGTTGGTCACTGAGTTTATTCTATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGTTTTCCAACTCGCCCTGAACTGCAGATTGTCCTGTTCCTCATGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGTTTTCCAACTCGCCCTGAACTGCAGATTGTCCTGTTCCTCATGTTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGACATTGTATGCTATAATTCTGATAGGGAACATTGGATTGATGCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGACATTGTATGCTATAATTCTGATAGGGAACATTGGATTGATGCTGTTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCAGGATTGATCCTCACCTTCAAACCCCCATGTATTTTTTCCTTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCAGGATTGATCCTCACCTTCAAACCCCCATGTATTTTTTCCTTAGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTATCATTTGTAGACCTTTGCTATTTCTCAGACATTGTTCCCAAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTATCATTTGTAGACCTTTGCTATTTCTCAGACATTGTTCCCAAAATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTCAATTTCCTCTCGGAGAACAAATCTATTTCCTATTATGGGTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTCAATTTCCTCTCGGAGAACAAATCTATTTCCTATTATGGGTGTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCAGTTTTATTTTTTCTGTACTTTTGCAGATACAGAATCCTTCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCAGTTTTATTTTTTCTGTACTTTTGCAGATACAGAATCCTTCATCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCGCCATGGCCTATGATCGCTATGTCGCCATCTGTAACCCTTTATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCGCCATGGCCTATGATCGCTATGTCGCCATCTGTAACCCTTTATTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACACAGTTGTGATGTCTAGGGGCATCTGTATGCGGTTGATTGTCTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACACAGTTGTGATGTCTAGGGGCATCTGTATGCGGTTGATTGTCTTGTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACCTTGGAGGCAACATGAGTTCCCTGGTTCACACATCCTTTGCCTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACCTTGGAGGCAACATGAGTTCCCTGGTTCACACATCCTTTGCCTTTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCTGAAATATTGTGACAAAAATGTTATTAATCATTTTTTCTGTGACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCTGAAATATTGTGACAAAAATGTTATTAATCATTTTTTCTGTGACCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCCCCTGCTTAAACTATCCTGCACTGACACAACAATTAATGAGTGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTCCCCTGCTTAAACTATCCTGCACTGACACAACAATTAATGAGTGGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCTCCACATACGGCAGCTCAGTGGAAATCATTTGTTTTATCATCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCTCCACATACGGCAGCTCAGTGGAAATCATTTGTTTTATCATCATCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATCTCCTACTTTTTCATTCTTCTCTCAGTCTTAAAGATCCGCTCTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATCTCCTACTTTTTCATTCTTCTCTCAGTCTTAAAGATCCGCTCTTTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTGGGAGGAAGAAGACCTTTTCTACATGCGCCTCTCACCTGACTTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTGGGAGGAAGAAGACCTTTTCTACATGCGCCTCTCACCTGACTTCAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACGATCTACCAAGGGACTCTCCTCTTTATTTACTCACGGCCCAGCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ACGATCTACCAAGGGACTCTCCTCTTTATTTACTCACGGCCCAGCTACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTATTCTCCAAACACTGATAAAATTATCTCAGTGTTCTACACCATTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTATTCTCCAAACACTGATAAAATTATCTCAGTGTTCTACACCATTTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTCCAGTGCTGAATCTGTTGATTTATAGTTTGAGAAATAAAGATGTAAAG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTCCAGTGCTGAATCCGTTGATTTATAGTTTGAGAAATAAAGATGTAAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GATGCAGCTGAGAAAGTTCTAAGATCAAAGGTAGATTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GATGCAGCTGAGAAAGTTCTAAGATCAAAGGTAGATTCTTCA