seq1 = pF1KE5987.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KE5987/gi568815587r_4846162.tfa (gi568815587r:4846162_4954774), 108613 bp

>pF1KE5987 939
>gi568815587r:4846162_4954774 (Chr11)

(complement)

1-939  (7675-8613)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCATTATCAACACATCATATGTTGAAATCACCACCTTCTTCTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7675 ATGTCCATTATCAACACATCATATGTTGAAATCACCACCTTCTTCTTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGATGCCAGGGCTAGAATATGCACACATCTGGATCTCTATCCCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7725 TGGGATGCCAGGGCTAGAATATGCACACATCTGGATCTCTATCCCCATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGCATGTATCTTATTGCTATTCTAGGAAATTGCACCATTCTTTTTATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
   7775 GCAGCATGTATCTTATTGCTATTCTAGGAAATGGCACCATTCTTTTTATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCAAGACAGAGCCCTCCTTGCATGAGCCCATGTACTATTTTCTTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7825 ATCAAGACAGAGCCCTCCTTGCATGAGCCCATGTACTATTTTCTTTCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTTGGCTATGTCAGACTTGGGTTTGTCTTTATCATCTCTGCCCACTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7875 GTTGGCTATGTCAGACTTGGGTTTGTCTTTATCATCTCTGCCCACTGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAAGCATCTTCCTGTTCAATGCTCCTGAAATTTCATCCAATGCCTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7925 TAAGCATCTTCCTGTTCAATGCTCCTGAAATTTCATCCAATGCCTGCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCCAGGAATTCTTCATTCATGGATTCTCAGTACTGGAGTCCTCAGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7975 GCCCAGGAATTCTTCATTCATGGATTCTCAGTACTGGAGTCCTCAGTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGATCATGTCATTTGATAGATTCCTAGCCATCCACAACCCTCTGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8025 CCTGATCATGTCATTTGATAGATTCCTAGCCATCCACAACCCTCTGAGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACACCTCAATCCTGACAACTGTCAGAGTTGCCCAAATAGGGATAGTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8075 ACACCTCAATCCTGACAACTGTCAGAGTTGCCCAAATAGGGATAGTATTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCTTTAAGAGCATGCTCCTGGTTCTTCCCTTCCCTTTCACTTTAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8125 TCCTTTAAGAGCATGCTCCTGGTTCTTCCCTTCCCTTTCACTTTAAGAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTGAGATATTGCAAGAAAAACCAATTATCCCATTCCTACTGTCTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8175 CTTGAGATATTGCAAGAAAAACCAATTATCCCATTCCTACTGTCTCCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGATGTCATGAAGTTGGCCTGTTCTGACAACAGAATTGATGTTATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8225 AGGATGTCATGAAGTTGGCCTGTTCTGACAACAGAATTGATGTTATCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCTTTTTTGGAGCACTCTGCCTTATGGTAGACTTTATTCTCATTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8275 GGCTTTTTTGGAGCACTCTGCCTTATGGTAGACTTTATTCTCATTGCTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTCTTACACCCTGATCCTCAAGACTGTACTGGGAATTGCATCCAAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8325 GTCTTACACCCTGATCCTCAAGACTGTACTGGGAATTGCATCCAAAAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCAGCTTAAGGCTCTCAATACTTGTGTTTCACACATCTGTGCAGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8375 AGCAGCTTAAGGCTCTCAATACTTGTGTTTCACACATCTGTGCAGTGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCTTCTACCTGCCCATCATCAACCTGGCCGTTGTCCACCGCTTTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8425 ATCTTCTACCTGCCCATCATCAACCTGGCCGTTGTCCACCGCTTTGCCCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCATGTCTCTCCCCTCATTAATGTTCTCATGGCAAATGTTCTCCTACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8475 GCATGTCTCTCCCCTCATTAATGTTCTCATGGCAAATGTTCTCCTACTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TACCTCCACTGATGAACCCAATTGTTTATTGTGTAAAAACTAAACAGATT
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8525 TACCTCCACTGACGAACCCAATTGTTTATTGTGTAAAAACTAAACAGATT

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 AGAGTGAGAGTTGTAGCAAAATTGTGTCAACGGAAGATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8575 AGAGTGAGAGTTGTAGCAAAATTGTGTCAACGGAAGATT