seq1 = pF1KE5975.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5975/gi568815592f_29340016.tfa (gi568815592f:29340016_29540951), 200936 bp

>pF1KE5975 936
>gi568815592f:29340016_29540951 (Chr6)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGCAAACACCTCCATGGTGACTGAGTTTCTTCTTCTCGGCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGCAAACACCTCCATGGTGACTGAGTTTCTTCTTCTCGGCTTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACCTGGCCGACCTCCAGGGCTTGCTCTTCTCTGTCTTTCTCACTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCACCTGGCCGACCTCCAGGGCTTGCTCTTCTCTGTCTTTCTCACTATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCTGCTGACCGTGGCAGGCAATTTCCTCATTGTGGTGCTGGTCTCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCTGCTGACCGTGGCAGGCAATTTCCTCATTGTGGTGCTGGTCTCCACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGCTGCCCTCCAGTCCCCTATGTACTTCTTCCTGCGCACCCTCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGCTGCCCTCCAGTCCCCTATGTACTTCTTCCTGCGCACCCTCTCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTGGAGATTGGCTATACGTCTGTCACGGTCCCCCTGCTACTTCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTGGAGATTGGCTATACGTCTGTCACGGTCCCCCTGCTACTTCACCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCTTACTGGCCGGCGCCACATCTCTCGCTCTGGATGTGCTCTCCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCTTACTGGCCGGCGCCACATCTCTCGCTCTGGATGTGCTCTCCAGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTCTTCCTCTTCTTTGGCGCCACGGAGTGCTGCCTCCTGGCAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTCTTCCTCTTCTTTGGCGCCACGGAGTGCTGCCTCCTGGCAGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCTATGACCGCTATGCAGCCATCTGTGAACCCCTCCGCTACCCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCTATGACCGCTATGCAGCCATCTGTGAACCCCTCCGCTACCCACTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTGAGCCACCGGGTGTGTCTACAGCTAGCTGGGTCGGCGTGGGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCTGAGCCACCGGGTGTGTCTACAGCTAGCTGGGTCGGCGTGGGCCTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGGTGCTGGTGGGGCTGGGCCACACCCCTTTCATCTTCTCTTTGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGGTGCTGGTGGGGCTGGGCCACACCCCTTTCATCTTCTCTTTGCCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCGGCCCCAATACCATCCCGCAGTTCTTCTGTGAGATCCAGCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGCGGCCCCAATACCATCCCGCAGTTCTTCTGTGAGATCCAGCCTGTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCAGCTGGTATGTGGAGACACCTCGCTTAATGAACTGCAGATTATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCAGCTGGTATGTGGAGACACCTCGCTTAATGAACTGCAGATTATCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCAACAGCCCTCCTCATCCTCTGCCCCTTTGGCCTCATCCTGGGCTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCAACAGCCCTCCTCATCCTCTGCCCCTTTGGCCTCATCCTGGGCTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGGGCGTATCCTCGTTACCATCTTCCGGATCCCATCTGTTGCGGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGGGCGTATCCTCGTTACCATCTTCCGGATCCCATCTGTTGCGGGCCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCAAGGCCTTCTCCACCTGCTCCTCCCACCTGATCATGGTCTCCCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCAAGGCCTTCTCCACCTGCTCCTCCCACCTGATCATGGTCTCCCTCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGGCACCGCACTCTTTATCTATATTCGCCCTAAGGCCAGCTACGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGGCACCGCACTCTTTATCTATATTCGCCCTAAGGCCAGCTACGATCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCCACTGACCCTCTGGTGTCCCTCTTCTATGCTGTGGTCACCCCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCCACTGACCCTCTGGTGTCCCTCTTCTATGCTGTGGTCACCCCCATCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCAACCCCATCATCTACAGCCTGCGGAACACAGAGGTCAAAGCTGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCAACCCCATCATCTACAGCCTGCGGAACACAGAGGTCAAAGCTGCCCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 AAGAGAACCATCCAGAAAACGGTGCCTATGGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGAGAACCATCCAGAAAACGGTGCCTATGGAGATT