seq1 = pF1KE5971.tfa, 936 bp
seq2 = pF1KE5971/gi568815589r_35769466.tfa (gi568815589r:35769466_35970401), 200936 bp

>pF1KE5971 936
>gi568815589r:35769466_35970401 (Chr9)

(complement)

1-936  (100001-100936)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCGCTCAACAGAACAGAGGTGTCCGAGTTCTTTCTGAAAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCGCTCAACAGAACAGAGGTGTCCGAGTTCTTTCTGAAAGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCTGGCTACCCAGCCCTGGAGCATCTGCTCTTCCCTCTGTGCTCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCTGGCTACCCAGCCCTGGAGCATCTGCTCTTCCCTCTGTGCTCAGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTGGTGACCCTCCTGGGGAACACAGCCATCATGGCGGTGAGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTGGTGACCCTCCTGGGGAACACAGCCATCATGGCGGTGAGCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTAGATATCCACCTGCACACGCCCGTGTACTTCTTCCTGGGCAACCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTAGATATCCACCTGCACACGCCCGTGTACTTCTTCCTGGGCAACCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TACCCTGGACATCTGCTACACGCCCACCTTTGTGCCTCTGATGCTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TACCCTGGACATCTGCTACACGCCCACCTTTGTGCCTCTGATGCTGGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTCCTGTCATCCCGGAAGACCATCTCCTTTGCTGTCTGTGCCATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTCCTGTCATCCCGGAAGACCATCTCCTTTGCTGTCTGTGCCATCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTGTCTGAGCCTGTCCACGGGCTCCACGGAGTGCCTGCTACTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTGTCTGAGCCTGTCCACGGGCTCCACGGAGTGCCTGCTACTGGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACGGCCTATGACCGCTACCTGGCCATCTGCCAGCCACTCAGGTACCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACGGCCTATGACCGCTACCTGGCCATCTGCCAGCCACTCAGGTACCACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTCATGAGCCACCGGCTCTGCGTGCTGCTGATGGGAGCTGCCTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCTCATGAGCCACCGGCTCTGCGTGCTGCTGATGGGAGCTGCCTGGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCTGCCTCCTCAAGTCGGTGACTGAGATGGTCATCTCCATGAGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCTGCCTCCTCAAGTCGGTGACTGAGATGGTCATCTCCATGAGGCTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTGGCCACCACGTGGTCAGTCACTTCACCTGCAAGATCCTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTGGCCACCACGTGGTCAGTCACTTCACCTGCAAGATCCTGGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTGAAGCTGGCATGCGGCAACACGTCGGTCAGCGAAGACTTCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTGAAGCTGGCATGCGGCAACACGTCGGTCAGCGAAGACTTCCTGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCGGGCTCCATCCTGCTGCTGCCTGTACCCCTGGCATTCATCTGCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCGGGCTCCATCCTGCTGCTGCCTGTACCCCTGGCATTCATCTGCCTGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACTTGCTCATCCTGGCCACCATCCTGAGGGTGCCCTCGGCCGCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACTTGCTCATCCTGGCCACCATCCTGAGGGTGCCCTCGGCCGCCAGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCTGCAAAGCCTTCTCCACCTGCTTGGCACACCTGGCTGTAGTGCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCTGCAAAGCCTTCTCCACCTGCTTGGCACACCTGGCTGTAGTGCTGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTACGGCACCATCATCTTCATGTACTTGAAGCCCAAGAGTAAGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTACGGCACCATCATCTTCATGTACTTGAAGCCCAAGAGTAAGGAAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCACATCTCTGATGAGGTCTTCACAGTCCTCTATGCCATGGTCACGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCACATCTCTGATGAGGTCTTCACAGTCCTCTATGCCATGGTCACGACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGAACCCCACCATCTACAGCCTGAGGAACAAGGAGGTGAAGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGAACCCCACCATCTACAGCCTGAGGAACAAGGAGGTGAAGGAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 GCCAGGAAGGTGTGGGGCAGGAGTCGGGCCTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCAGGAAGGTGTGGGGCAGGAGTCGGGCCTCCAGG