seq1 = pF1KE5936.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KE5936/gi568815591f_143903997.tfa (gi568815591f:143903997_144104929), 200933 bp

>pF1KE5936 933
>gi568815591f:143903997_144104929 (Chr7)

1-933  (100001-100933)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTTGGAGAACCAGACACGAGTCACCAAGTTCATTCTGGTGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTTGGAGAACCAGACACGAGTCACCAAGTTCATTCTGGTGGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCTGGGAGCTTGAGTATGCGGGCAGCCATGTTTCTGATATTCCTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCTGGGAGCTTGAGTATGCGGGCAGCCATGTTTCTGATATTCCTTGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTATATTCTGACAGTGGCTGAAAACGTGATCATCATCCTATTGGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTATATTCTGACAGTGGCTGAAAACGTGATCATCATCCTATTGGTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAAAATCGGCCACTGCACAAGCCTATGTACTTCTTCCTGGCCAACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAAAATCGGCCACTGCACAAGCCTATGTACTTCTTCCTGGCCAACCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCTTGGAGACCTGGTACATCTCTGTGACTGTGCCCAAGTTACTGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCTTGGAGACCTGGTACATCTCTGTGACTGTGCCCAAGTTACTGTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTTTTTGGTCTGTGAACAACAGCATCTCTTTCACACTCTGTATGATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTTTTTGGTCTGTGAACAACAGCATCTCTTTCACACTCTGTATGATACAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGTACTTCTTCATTGCTCTCATGTGCACAGAATGTGTGCTTCTGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGTACTTCTTCATTGCTCTCATGTGCACAGAATGTGTGCTTCTGGCCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGCCTATGACCGGTATGTGGCCATCTGTCGCCCACTCCACTACCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGCCTATGACCGGTATGTGGCCATCTGTCGCCCACTCCACTACCCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATAATGAGCCATGGGCTCTGCTTCCGCCTCGCTCTTGGTTCCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATAATGAGCCATGGGCTCTGCTTCCGCCTCGCTCTTGGTTCCTGGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATTGGCTTTGGCATCTCCCTGGCGAAGATCTACTTCATCTCCTGCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATTGGCTTTGGCATCTCCCTGGCGAAGATCTACTTCATCTCCTGCCTCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTGGTCCCAATGTCATCAACCACTTCTTCTGTGACATCTCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTGGTCCCAATGTCATCAACCACTTCTTCTGTGACATCTCTCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TACTTAATCTCTCCTGCACAGACATGTCCATAACTGAGTTGGTAGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TACTTAATCTCTCCTGCACAGACATGTCCATAACTGAGTTGGTAGACTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCCTGGCACTGGTCATCTTCCTATTCCCACTCTTTATTACTGTCCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCCTGGCACTGGTCATCTTCCTATTCCCACTCTTTATTACTGTCCTGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACGGATGCATTCTGGCCACCATATTATGCATGCCCACAGGAAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACGGATGCATTCTGGCCACCATATTATGCATGCCCACAGGAAAGCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAGCGTTCTCCACTTGTGCCTCCCATCTTGTGGTGGTCACCATTTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGCGTTCTCCACTTGTGCCTCCCATCTTGTGGTGGTCACCATTTTCTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCAGCCATTATTTTCATGTATGCTCGACCTCGAGTTATCCATGCCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCAGCCATTATTTTCATGTATGCTCGACCTCGAGTTATCCATGCCTTCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATGAACAAAATTATTTCCATCTTCTATGCCATTGTCACTCCTTCTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATGAACAAAATTATTTCCATCTTCTATGCCATTGTCACTCCTTCTCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCCTTTCATTTATTGCCTAAGAAACCGAGAGGTCAAGGAAGCTCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCCTTTCATTTATTGCCTAAGAAACCGAGAGGTCAAGGAAGCTCTGAAG

    900     .    :    .    :    .    :
    901 AAACTGGCATATTGCCAGGCCAGCAGATCTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAACTGGCATATTGCCAGGCCAGCAGATCTGAC