seq1 = pF1KE5921.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KE5921/gi568815589f_122623990.tfa (gi568815589f:122623990_122824922), 200933 bp

>pF1KE5921 933
>gi568815589f:122623990_122824922 (Chr9)

1-933  (100001-100933)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACAAAGAATTATAGCAGCAGCACCTCAGGCTTCATCCTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACAAAGAATTATAGCAGCAGCACCTCAGGCTTCATCCTCCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCTCTTCCAACCCTAAGCTGCAGAAACCTCTCTTTGCCATCTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCTCTTCCAACCCTAAGCTGCAGAAACCTCTCTTTGCCATCTTCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATGTACCTACTCACTGCGGTGGGGAATGTGCTCATCATCCTGGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATGTACCTACTCACTGCGGTGGGGAATGTGCTCATCATCCTGGCCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACTCTGACCCCAGGCTCCACACCCCTATGTACTTTTTTCTCAGCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACTCTGACCCCAGGCTCCACACCCCTATGTACTTTTTTCTCAGCAACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTCTTTCATGGATATCTGCTTCACAACAGTCATAGTGCCTAAGATGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTCTTTCATGGATATCTGCTTCACAACAGTCATAGTGCCTAAGATGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAATTTTCTATCAGAGACAAAGATTATCTCTTATGTGGGCTGCCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGAATTTTCTATCAGAGACAAAGATTATCTCTTATGTGGGCTGCCTGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGATGTACTTCTTCATGGCATTTGGGAACACTGACAGCTACCTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGATGTACTTCTTCATGGCATTTGGGAACACTGACAGCTACCTGCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCTATGGCCATCGACCGGCTGGTGGCCATCTGCAACCCCTTACACTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCTATGGCCATCGACCGGCTGGTGGCCATCTGCAACCCCTTACACTATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGTGGTTATGAAACCATGGCATTGCCTACTCATGCTATTGGGTTCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGTGGTTATGAAACCATGGCATTGCCTACTCATGCTATTGGGTTCTTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCATCTCCCACCTACATTCCCTGTTCCGCGTGCTACTTATGTCTCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCATCTCCCACCTACATTCCCTGTTCCGCGTGCTACTTATGTCTCGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTCTTTCTGTGCCTCTCACATCATTAAGCACTTTTTCTGTGACACCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTCTTTCTGTGCCTCTCACATCATTAAGCACTTTTTCTGTGACACCCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGTGCTAAAGCTCTCCTGCTCTGACACATCCTCCAGCCAGATGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGTGCTAAAGCTCTCCTGCTCTGACACATCCTCCAGCCAGATGGTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGACTGAGACCTTAGCTGTCATTGTGACCCCCTTCCTGTGTACCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGACTGAGACCTTAGCTGTCATTGTGACCCCCTTCCTGTGTACCATCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCCTACCTGCAAATCATCGTCACTGTGCTCAGAATCCCCTCTGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100651 CTCCTACCTGCAAATCATCGTCACTGTGCTCAGAATCCCCTCTGCAGCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAAGTGGAAGGCCTTCTCTACCTGTGGCTCCCACCTCACTGTAGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAAGTGGAAGGCCTTCTCTACCTGTGGCTCCCACCTCACTGTAGTGGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGTTCTATGGGAGTGTCATCTATGTCTATTTTAGGCCTCTGTCCATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGTTCTATGGGAGTGTCATCTATGTCTATTTTAGGCCTCTGTCCATGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCAGTGATGAAGGGCCGGGTAGCCACAGTTATGTACACAGTAGTGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTCAGTGATGAAGGGCCGGGTAGCCACAGTTATGTACACAGTAGTGACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCATGCTGAACCCTTTCATCTACAGCCTGAGGAACAAAGATATGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCATGCTGAACCCTTTCATCTACAGCCTGAGGAACAAAGATATGAAAAGG

    900     .    :    .    :    .    :
    901 GGTTTGAAGAAATTAAGACACAGAATTTACTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGTTTGAAGAAATTAAGACACAGAATTTACTCA