seq1 = pF1KE5715.tfa, 1893 bp
seq2 = pF1KE5715/gi568815585f_24996199.tfa (gi568815585f:24996199_25198091), 201893 bp

>pF1KE5715 1893
>gi568815585f:24996199_25198091 (Chr13)

1-1893  (100001-101893)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCCCAGCACCCCCAGCTACCCAACGGCCTCGCTCTACGTGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCCCAGCACCCCCAGCTACCCAACGGCCTCGCTCTACGTGGGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCCACCCCGACGTGACTGAGGCGATGCTCTACGAGAAGTTCAGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCCACCCCGACGTGACTGAGGCGATGCTCTACGAGAAGTTCAGCCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGGCCCATCCTCTCCATCCGGATCTGCAGGGACTTGATCACCAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGGCCCATCCTCTCCATCCGGATCTGCAGGGACTTGATCACCAGCGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTCCAACTACGCGTATGTGAACTTCCAGCATACGAAGGACGCGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTCCAACTACGCGTATGTGAACTTCCAGCATACGAAGGACGCGGAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCTCTGGACACCATGAATTTTGATGTTATAAAGGGCAAGCCAGTACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCTCTGGACACCATGAATTTTGATGTTATAAAGGGCAAGCCAGTACGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATGTGGTCTCAGCGTGATCCATCACTTCGAAAAAGTGGAGTGGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATGTGGTCTCAGCGTGATCCATCACTTCGAAAAAGTGGAGTGGGCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATATTCGTTAAAAATCTGGATAAGTCCATTAATAATAAAGCACTGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATATTCGTTAAAAATCTGGATAAGTCCATTAATAATAAAGCACTGTATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TACAGTTTCTGCTTTTGGTAACATCCTTTCGTGTAACGTGGTTTGTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TACAGTTTCTGCTTTTGGTAACATCCTTTCGTGTAACGTGGTTTGTGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAAATGGTTCCAAGGGTTATGGATTTGTACACTTTGAGACACACGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAAATGGTTCCAAGGGTTATGGATTTGTACACTTTGAGACACACGAAGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGAAAGAGCTATTAAAAAAATGAACGGAATGCTCCTAAATGGTCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTGAAAGAGCTATTAAAAAAATGAACGGAATGCTCCTAAATGGTCGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTATTTGTTGGACAATTTAAGTCTCGTAAAGAACGAGAAGCTGAACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGTATTTGTTGGACAATTTAAGTCTCGTAAAGAACGAGAAGCTGAACTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GAGCTAGGGCAAAAGAGTTCCCCAATGTTTACATCAAGAATTTTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GAGCTAGGGCAAAAGAGTTCCCCAATGTTTACATCAAGAATTTTGGAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GACATGGATGATGAGCGCCTTAAGGATCTCTTTGGCAAGTTCGGGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GACATGGATGATGAGCGCCTTAAGGATCTCTTTGGCAAGTTCGGGCCCGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTTAAGTGTGAAAGTAATGACCGATGAAAGTGGAAAATCCAAAGGATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTTAAGTGTGAAAGTAATGACCGATGAAAGTGGAAAATCCAAAGGATTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GATTTGTAAGCTTTGAAAGGCATGAAGATGCACAGAAAGCTGTAGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GATTTGTAAGCTTTGAAAGGCATGAAGATGCACAGAAAGCTGTAGATGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATGAATGGAAAGGAGCTCAATGGAAAACAAATTTACGTTGGTCGAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATGAATGGAAAGGAGCTCAATGGAAAACAAATTTACGTTGGTCGAGCTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAAAAAAGTGGAACGGCAGACGGAACTTAAGCGCACATTTGAACAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAAAAAAGTGGAACGGCAGACGGAACTTAAGCGCACATTTGAACAGATGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGCAAGATAGGATCACCAGATACCAGGTTGTTAATCTTTATGTGAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGCAAGATAGGATCACCAGATACCAGGTTGTTAATCTTTATGTGAAAAAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTTGATGATGGTATTGATGATGAACGTCTCCGGAAAGCGTTTTCTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTTGATGATGGTATTGATGATGAACGTCTCCGGAAAGCGTTTTCTCCATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGGTACAATCACTAGTGCAAAGGTTATGATGGAAGGTGGTCGCAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGGTACAATCACTAGTGCAAAGGTTATGATGGAAGGTGGTCGCAGCAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GGTTTGGTTTTGTATGTTTCTCCTCCCCAGAAGAAGCCACTAAAGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GGTTTGGTTTTGTATGTTTCTCCTCCCCAGAAGAAGCCACTAAAGCAGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ACAGAAATGAACGGTAGAATTGTGGCCACAAAGCCATTGTATGTAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ACAGAAATGAACGGTAGAATTGTGGCCACAAAGCCATTGTATGTAGCTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 AGCTCAGCGCAAAGAAGAGCGCCAGGCTTACCTCACTAACGAGTATATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 AGCTCAGCGCAAAGAAGAGCGCCAGGCTTACCTCACTAACGAGTATATGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGAGAATGGCAAGTGTACGAGCTGTGCCCAACCAGCGAGCACCTCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGAGAATGGCAAGTGTACGAGCTGTGCCCAACCAGCGAGCACCTCCTTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GGTTACTTCATGACAGCTGTCCCGCAGACTCAGAACCATGCTGCATACTA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 101201 GGTTACTTCATGACAGCTGTCCCACAGACTCAGAACCATGCTGCATACTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TCCTCCTAGCCAAATTGCTCGACTAAGACCAAGTCCTCGCTGGACTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TCCTCCTAGCCAAATTGCTCGACTAAGACCAAGTCCTCGCTGGACTGCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGGGTGCCAGACCTCATCCATTCCAAAATAAGCCCAGTGCTATCCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGGGTGCCAGACCTCATCCATTCCAAAATAAGCCCAGTGCTATCCGCCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GGTGCTCCTAGAGTACCATTTAGTACTATGAGACCAGCTTCTTCACAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GGTGCTCCTAGAGTACCATTTAGTACTATGAGACCAGCTTCTTCACAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 TCCACGAGTCATGTCAACGCAGCGTGTTGCTAACACATCAACACAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 TCCACGAGTCATGTCAACGCAGCGTGTTGCTAACACATCAACACAGACAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TGGGTCCACGTCCTGCAGCTGCTGCTGCTGCTGCAGCTACCCCTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TGGGTCCACGTCCTGCAGCTGCTGCTGCTGCTGCAGCTACCCCTGCTGTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CGCACGGTTCCACGGTATAAATATGCTGCGGGAGTTCGCAATCCTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CGCACGGTTCCACGGTATAAATATGCTGCGGGAGTTCGCAATCCTCAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 ACATCGTAATGCACAGCCACAAGTTACAATGCAACAGCTTGCTGTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 ACATCGTAATGCACAGCCACAAGTTACAATGCAACAGCTTGCTGTTCATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TACAAGGTCAGGAAACTTTGACTGCCTCCAGGTTGGCATCTGCCCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TACAAGGTCAGGAAACTTTGACTGCCTCCAGGTTGGCATCTGCCCCTCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 CAAAAGCAAAAGCAAATGTTAGGTGAACGGCTCTTTCCTCTTATTCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 CAAAAGCAAAAGCAAATGTTAGGTGAACGGCTCTTTCCTCTTATTCAAGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CATGCACCCTACTCTTGCTGGGAAAATCACTGGCATGTTGTTGGAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CATGCACCCTACTCTTGCTGGGAAAATCACTGGCATGTTGTTGGAGATTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 ATAATTCAGAACTTCTTTATATGCTCGAGTCTCCAGAGTCACTCCGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 ATAATTCAGAACTTCTTTATATGCTCGAGTCTCCAGAGTCACTCCGTTCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 AAGGTTGATGAAGCTGTAGCTGTACTACAAGCCCACCAAGCTAAAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 AAGGTTGATGAAGCTGTAGCTGTACTACAAGCCCACCAAGCTAAAGAGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 TACCCAGAAAGCAGTTAACAGTGCTACCGGTGTTCCAACTGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 TACCCAGAAAGCAGTTAACAGTGCTACCGGTGTTCCAACTGTT