seq1 = pF1KE5634.tfa, 1752 bp
seq2 = pF1KE5634/gi568815578r_53844925.tfa (gi568815578r:53844925_54158718), 313794 bp

>pF1KE5634 1752
>gi568815578r:53844925_54158718 (Chr20)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-142  (100565-100634)   100% ->
143-723  (129747-130327)   100% ->
724-882  (162669-162827)   99% ->
883-927  (163663-163707)   100% ->
928-1140  (173220-173432)   100% ->
1141-1182  (183289-183330)   100% ->
1183-1350  (191646-191813)   100% ->
1351-1416  (201222-201287)   100% ->
1417-1680  (205024-205287)   100% ->
1681-1752  (213723-213794)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTAACCAAATGAGTGTTCCCCAAAGAGTTGAAGACCAAGAGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTAACCAAATGAGTGTTCCCCAAAGAGTTGAAGACCAAGAGAATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCAGAAGCAGAGACTTACCAG         GACAACGCGTCTGCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 ACCAGAAGCAGAGACTTACCAGGTA...CAGGACAACGCGTCTGCTCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACGGGGTTCCAGTGGTGGTGTCGACCCACACAGTTCAGCACTTAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100584 ACGGGGTTCCAGTGGTGGTGTCGACCCACACAGTTCAGCACTTAGAGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 G         TCGACTTGGGAATAAGTGTCAAGACGGATAATGTGGCCAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100634 GGTC...CAGTCGACTTGGGAATAAGTGTCAAGACGGATAATGTGGCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTCTTCCCCCGAGACAACGGAGATAAGTGCTGTTGCGGATGCCAACGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129787 TTCTTCCCCCGAGACAACGGAGATAAGTGCTGTTGCGGATGCCAACGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAATCTTGGGAAAGAGGCCAAACCCGAGGCACCAGCTGCTAAATCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129837 AGAATCTTGGGAAAGAGGCCAAACCCGAGGCACCAGCTGCTAAATCTCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTTTCTTGATGCTCTCTCGGCCTGTACCAGGACGTACCGGAGACCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129887 TTTTTCTTGATGCTCTCTCGGCCTGTACCAGGACGTACCGGAGACCAAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGCAGATTCATCCCTTGGATCAGTGAAGCTTGATGTCAGCTCCAATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129937 CGCAGATTCATCCCTTGGATCAGTGAAGCTTGATGTCAGCTCCAATAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTCCAGCGAACAAAGACCCAAGTGAGAGCTGGACACTTCCGGTGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129987 CTCCAGCGAACAAAGACCCAAGTGAGAGCTGGACACTTCCGGTGGCAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGACCGGGGCAGGACACAGATAAAACCCCAGGGCACGCCCCGGCCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130037 GGACCGGGGCAGGACACAGATAAAACCCCAGGGCACGCCCCGGCCCAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAAGGTCCTCTCTGCCGCCAGGGATCCCACGCTTCTCCCACCTGAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130087 CAAGGTCCTCTCTGCCGCCAGGGATCCCACGCTTCTCCCACCTGAGACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGGGAGCAGGAGGAGAAGCTCCCTCCAAGCCCAAGGACTCCAGCTTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130137 GGGGAGCAGGAGGAGAAGCTCCCTCCAAGCCCAAGGACTCCAGCTTTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GACAAATTCTTCAAGCTGGACAAGGGACAGGAAAAGGTGCCAGGTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130187 GACAAATTCTTCAAGCTGGACAAGGGACAGGAAAAGGTGCCAGGTGACAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCAACAGGAAGCCAAGAGGGCAGAGCATCAAGACAAGGTGGATGAGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130237 CCAACAGGAAGCCAAGAGGGCAGAGCATCAAGACAAGGTGGATGAGGTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTGGCTTATCAGGGCAGTCCGATGATGTCCCTGCAGGGAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 130287 CTGGCTTATCAGGGCAGTCCGATGATGTCCCTGCAGGGAAGGTA...TAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GACATAGTTGACGGCAAGGAAAAAGAAGGACAAGAACTTGGAACTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162669 GACATAGTTGACGGCAAGGAAAAAGAAGGACAAGAACTTGGAACTGCGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TTGCTCTGTCCCTGGGGACCCAGAAGGACTGGAGACTGCAAAGGACGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162719 TTGCTCTGTCCCTGGGGACCCAGAAGGACTGGAGACTGCAAAGGACGATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCCAGGCAGCAGCTATAGCAGAGAATAATAATTCTATCATGAGTTTCTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 162769 CCCAGGCAGCAGCTATAGCAGAGAATAATAATTCCATCATGAGTTTCTTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AAAACTCTG         GTTTCACCTAACAAAGCTGAAACAAAAAAGGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 162819 AAAACTCTGGTA...AAGGTTTCACCTAACAAAGCTGAAACAAAAAAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCCAGAAGACACG         GGTGCTGAAAAGTCACCCACCACTTCAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 163695 CCCAGAAGACACGGTA...TAGGGTGCTGAAAAGTCACCCACCACTTCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTGACCTTAAGTCAGACAAAGCCAACTTTACATCCCAGGAGACCCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173248 CTGACCTTAAGTCAGACAAAGCCAACTTTACATCCCAGGAGACCCAAGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GCTGGCAAGAATTCCAAAGGATGCAACCCATCGGGGCACACACAGTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173298 GCTGGCAAGAATTCCAAAGGATGCAACCCATCGGGGCACACACAGTCCGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GACAACCCCTGAACCTGCGAAGGAAGGCACCAAGGAGAAATCAGGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173348 GACAACCCCTGAACCTGCGAAGGAAGGCACCAAGGAGAAATCAGGACCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CCTCTCTGCCTCTGGGCAAACTGTTTTGGAAAAAG         TCAGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 173398 CCTCTCTGCCTCTGGGCAAACTGTTTTGGAAAAAGGTA...TAGTCAGTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AAAGAGGACTCAGTCCCCACAGGTGCGGAGGAGAAT         GTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 183295 AAAGAGGACTCAGTCCCCACAGGTGCGGAGGAGAATGTA...CAGGTGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GTGTGAGTCACCAGTAGAGATTATAAAGTCCAAGGAAGTAGAATCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191651 GTGTGAGTCACCAGTAGAGATTATAAAGTCCAAGGAAGTAGAATCAGCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TACAAACAGTGGACCTCAACGAAGGAGATGCTGCACCTGAACCCACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191701 TACAAACAGTGGACCTCAACGAAGGAGATGCTGCACCTGAACCCACAGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GCGAAACTCAAAAGAGAAGAAAGCAAACCAAGAACCTCTCTGATGGCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191751 GCGAAACTCAAAAGAGAAGAAAGCAAACCAAGAACCTCTCTGATGGCGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TCTCAGACAAATG         TCAGTGAAAGGGGATGGAGGGATCACCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 191801 TCTCAGACAAATGGTA...TAGTCAGTGAAAGGGGATGGAGGGATCACCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ACTCAGAAGAAATAAATGGGAAAGACTCCAGCTGCCAA         ACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 201250 ACTCAGAAGAAATAAATGGGAAAGACTCCAGCTGCCAAGTA...TAGACA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TCAGACTCCACAGAAAAGACTATCACACCGCCAGAGCCTGAACCAACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205027 TCAGACTCCACAGAAAAGACTATCACACCGCCAGAGCCTGAACCAACAGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 AGCACCACAGAAGGGTAAAGAGGGCTCCTCGAAGGACAAGAAGTCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205077 AGCACCACAGAAGGGTAAAGAGGGCTCCTCGAAGGACAAGAAGTCAGCAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CCGAGATGAACAAGCAGAAGAGCAACAAGCAGGAAGCCAAAGAACCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205127 CCGAGATGAACAAGCAGAAGAGCAACAAGCAGGAAGCCAAAGAACCAGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CAGTGCACAGAGCAGGCCACGGTGGACACGAACTCACTGCAGAATGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205177 CAGTGCACAGAGCAGGCCACGGTGGACACGAACTCACTGCAGAATGGGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CAAGCTCCAAAAGAGACCTGAGAAGCGGCAGCAGTCCCTTGGGGGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205227 CAAGCTCCAAAAGAGACCTGAGAAGCGGCAGCAGTCCCTTGGGGGCTTCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TTAAAGGCCTG         GGACCAAAGCGGATGTTGGATGCTCAAGTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 205277 TTAAAGGCCTGGTA...CAGGGACCAAAGCGGATGTTGGATGCTCAAGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CAAACAGACCCAGTATCCATCGGACCAGTTGGCAAATCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213753 CAAACAGACCCAGTATCCATCGGACCAGTTGGCAAATCCAAG