seq1 = pF1KE5615.tfa, 1713 bp
seq2 = pF1KE5615/gi568815590r_23285931.tfa (gi568815590r:23285931_23548941), 263011 bp

>pF1KE5615 1713
>gi568815590r:23285931_23548941 (Chr8)

(complement)

1-206  (99996-100200)   98% ->
207-412  (101057-101262)   100% ->
413-563  (104336-104486)   100% ->
564-667  (104989-105092)   100% ->
668-727  (106876-106935)   100% ->
728-858  (107219-107349)   100% ->
859-1025  (109027-109193)   100% ->
1026-1350  (111684-112008)   100% ->
1351-1436  (113465-113550)   100% ->
1437-1598  (114464-114625)   100% ->
1599-1713  (162897-163011)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAGGATTGGCATCTCCTGTCTTTTTCCTGCTTCTTGGCATTTTAG
        ||   -||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99996 ATTTC AGGATTGGCATCTCCTGTCTTTTTCCTGCTTCTTGGCATTTTAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATATCTCCAGTAGGGTGTCCTCGAATTCTGAATACCAATTTACGCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 CATATCTCCAGTAGGGTGTCCTCGAATTCTGAATACCAATTTACGCCAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTATGGTCATTAGTGTCCTGGCTGCTGCTGTTTCACTTTTATATTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100095 TTATGGTCATTAGTGTCCTGGCTGCTGCTGTTTCACTTTTATATTTTTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTGTCATAATCCGAAATAAGTATGGGCGACTAACCAGAGACAAGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100145 GTTGTCATAATCCGAAATAAGTATGGGCGACTAACCAGAGACAAGAAATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCAAAG         GTACCTGGCACGAGTTACCGACATTGAAGCTACAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100195 TCAAAGGTA...AAGGTACCTGGCACGAGTTACCGACATTGAAGCTACAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACACCAATAACCCCAATGTGAACTATGGGATCGTGGTGGACTGTGGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101092 ACACCAATAACCCCAATGTGAACTATGGGATCGTGGTGGACTGTGGTAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGTGGGTCTCGAGTATTTGTTTACTGCTGGCCAAGGCATAATGGCAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101142 AGTGGGTCTCGAGTATTTGTTTACTGCTGGCCAAGGCATAATGGCAATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACATGATCTGTTGGATATCAGGCAAATGAGGGATAAAAACCGAAAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101192 ACATGATCTGTTGGATATCAGGCAAATGAGGGATAAAAACCGAAAGCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGTCATGAAGATAAAACCGG         GCATTTCAGAATTTGCTACC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101242 TGGTCATGAAGATAAAACCGGGTA...TAGGCATTTCAGAATTTGCTACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCTCCAGAGAAAGTCAGTGATTACATTTCTCCACTTTTGAACTTTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104356 TCTCCAGAGAAAGTCAGTGATTACATTTCTCCACTTTTGAACTTTGCTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGAGCATGTGCCACGGGCAAAACACAAAGAGACACCTCTCTACATTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104406 AGAGCATGTGCCACGGGCAAAACACAAAGAGACACCTCTCTACATTCTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCACGGCTGGAATGAGAATCCTCCCCGAAAG         CCAGCAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 104456 GCACGGCTGGAATGAGAATCCTCCCCGAAAGGTG...CAGCCAGCAGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCTATTCTGGAAGACCTTCTGACCGATATCCCCGTGCACTTTGACTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104999 GCTATTCTGGAAGACCTTCTGACCGATATCCCCGTGCACTTTGACTTTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTTTTCTGACTCTCATGCAGAAGTAATTTCTGGGAAACAAGAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 105049 GTTTTCTGACTCTCATGCAGAAGTAATTTCTGGGAAACAAGAAGGTT...

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    668    GTGTGTATGCTTGGATTGGCATTAATTTTGTCCTTGGACGATTTGAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106873 TAGGTGTGTATGCTTGGATTGGCATTAATTTTGTCCTTGGACGATTTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CATATTGAAGATG         ATGATGAGGCCGTTGTGGAAGTTAACAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 106923 CATATTGAAGATGGTA...TAGATGATGAGGCCGTTGTGGAAGTTAACAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCCTGGAAGTGAAAGCAGCGAAGCCATTGTCCGTAAAAGGACAGCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107247 TCCTGGAAGTGAAAGCAGCGAAGCCATTGTCCGTAAAAGGACAGCGGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTCTCGACATGGGCGGCGTGTCGACTCAGATAGCGTACGAAGTCCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107297 TTCTCGACATGGGCGGCGTGTCGACTCAGATAGCGTACGAAGTCCCCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ACT         GAAGAAGTAGCTAAAAACTTGTTAGCTGAATTTAACTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107347 ACTGTA...CAGGAAGAAGTAGCTAAAAACTTGTTAGCTGAATTTAACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGGATGTGATGTTCACCAAACTGAGCATGTGTATCGAGTCTATGTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109065 GGGATGTGATGTTCACCAAACTGAGCATGTGTATCGAGTCTATGTGGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CGTTTCTTGGGTTTGGTGGCAATGCTGCTCGACAGAGATACGAAGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109115 CGTTTCTTGGGTTTGGTGGCAATGCTGCTCGACAGAGATACGAAGACAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATATTTGCCAACACCATTCAAAAGAACAG         GCTCCTGGGTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 109165 ATATTTGCCAACACCATTCAAAAGAACAGGTA...TAGGCTCCTGGGTAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ACAGACTGGTCTGACTCCTGATATGCCGTACTTGGACCCCTGCCTACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111696 ACAGACTGGTCTGACTCCTGATATGCCGTACTTGGACCCCTGCCTACCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TAGACATTAAAGATGAAATCCAGCAAAATGGACAAACCATATACCTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111746 TAGACATTAAAGATGAAATCCAGCAAAATGGACAAACCATATACCTACGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGGACTGGAGACTTTGACCTGTGTCGAGAGACTATCCAGCCTTTCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111796 GGGACTGGAGACTTTGACCTGTGTCGAGAGACTATCCAGCCTTTCATGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TAAAACAAACGAGACCCAGACTTCCCTCAATGGGGTCTACCAGCCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111846 TAAAACAAACGAGACCCAGACTTCCCTCAATGGGGTCTACCAGCCCCCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTCACTTCCAGAACAGTGAATTCTATGGCTTCTCCGAATTCTACTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111896 TTCACTTCCAGAACAGTGAATTCTATGGCTTCTCCGAATTCTACTACTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ACCGAGGATGTGTTACGAATGGGGGGAGACTACAATGCTGCTAAATTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111946 ACCGAGGATGTGTTACGAATGGGGGGAGACTACAATGCTGCTAAATTTAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 TAAAGCTGCAAAG         GATTATTGTGCAACAAAGTGGTCCATTT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 111996 TAAAGCTGCAAAGGTA...CAGGATTATTGTGCAACAAAGTGGTCCATTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGCGGGAACGCTTTGACCGAGGACTGTACGCCTCTCATGCTGACCTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113493 TGCGGGAACGCTTTGACCGAGGACTGTACGCCTCTCATGCTGACCTCCAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AGGCTTAA         GTATCAGTGCTTCAAATCGGCCTGGATGTTTGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 113543 AGGCTTAAGTA...TAGGTATCAGTGCTTCAAATCGGCCTGGATGTTTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GGTGTTTCATAGGGGCTTTTCGTTTCCTGTCAACTATAAAAGCTTAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114497 GGTGTTTCATAGGGGCTTTTCGTTTCCTGTCAACTATAAAAGCTTAAAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CTGCCTTGCAAGTTTACGACAAGGAGGTTCAGTGGACCCTTGGAGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114547 CTGCCTTGCAAGTTTACGACAAGGAGGTTCAGTGGACCCTTGGAGCCATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CTCTACAGGACCCGCTTTCTACCATTAAG         GAAAATAGGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114597 CTCTACAGGACCCGCTTTCTACCATTAAGGTA...TAGGAAAATAGGGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GCTGATAATACCTTGCTCAGGGGGTTGTCCAAAGCTGTGTTGTGCAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162909 GCTGATAATACCTTGCTCAGGGGGTTGTCCAAAGCTGTGTTGTGCAGTAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GGCAGCCACCACCATATGGGGCCACCAAACACTTGCAATGTGCTGCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162959 GGCAGCCACCACCATATGGGGCCACCAAACACTTGCAATGTGCTGCTTGG

   1800 
   1711 AAT
        |||
 163009 AAT