seq1 = pF1KE5604.tfa, 1431 bp
seq2 = pF1KE5604/gi568815586r_32647207.tfa (gi568815586r:32647207_32855874), 208668 bp

>pF1KE5604 1431
>gi568815586r:32647207_32855874 (Chr12)

(complement)

1-779  (100001-100779)   100% ->
780-947  (101790-101957)   100% ->
948-1103  (105001-105156)   100% ->
1104-1274  (105768-105938)   100% ->
1275-1431  (108512-108668)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGCCCATCTTGCGGTCCTTTTCCTGGGGCCGGTGGTCTGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGCCCATCTTGCGGTCCTTTTCCTGGGGCCGGTGGTCTGGTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTAAATCTCTCAGTATTGTTGCCCTTGGGGCTGCGTAAGGCCCACTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTAAATCTCTCAGTATTGTTGCCCTTGGGGCTGCGTAAGGCCCACTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCTCAGGGGTTACTGGCAGCGCAGAAGGCTCGAGGTCTGTTCAAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGCTCAGGGGTTACTGGCAGCGCAGAAGGCTCGAGGTCTGTTCAAGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCTTCCCGGAGACGGGGACGAAAATAGAGCTCCCAGAGCTCTTCGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCTTCCCGGAGACGGGGACGAAAATAGAGCTCCCAGAGCTCTTCGACCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGCACGGCGAGTTTTCCCCAAACCATTTACTGTGGCTTCGACCCCACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGGCACGGCGAGTTTTCCCCAAACCATTTACTGTGGCTTCGACCCCACGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGACTCGCTTCATGTGGGTCATCTACTTGCGCTGCTGGGCCTGTTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAGACTCGCTTCATGTGGGTCATCTACTTGCGCTGCTGGGCCTGTTTCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGCAGCGAGCGGGCCACAACGTGATCGCGCTGGTGGGAGGCGCCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGCAGCGAGCGGGCCACAACGTGATCGCGCTGGTGGGAGGCGCCACGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCGCCTGGGAGACCCGAGCGGCCGTACCAAGGAACGCGAGGCGCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCGCCTGGGAGACCCGAGCGGCCGTACCAAGGAACGCGAGGCGCTGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CAGAGCGCGTGCGAGCCAACGCGCGAGCTCTGCGCCTAGGGCTTGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CAGAGCGCGTGCGAGCCAACGCGCGAGCTCTGCGCCTAGGGCTTGAGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGCGGCTAATCACCAGCAGCTTTTCACTGATGGGCGCTCCTGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGCGGCTAATCACCAGCAGCTTTTCACTGATGGGCGCTCCTGGGGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCACTGTGCTGGACAACTCGGCCTGGTACCAGAAGCAGCACCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCACTGTGCTGGACAACTCGGCCTGGTACCAGAAGCAGCACCTGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTTCCTGGCGGCAGTGGGGGGTCACTTCCGCATGGGGACGCTGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTTCCTGGCGGCAGTGGGGGGTCACTTCCGCATGGGGACGCTGCTGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGGCAGAGCGTGCAGCTGCGGCTCAAGAGCCCCGAGGGCATGAGCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGGCAGAGCGTGCAGCTGCGGCTCAAGAGCCCCGAGGGCATGAGCTTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGAGTTCTTTTACCAGGTGCTCCAGGCCTATGACTTCTATTACCTCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGAGTTCTTTTACCAGGTGCTCCAGGCCTATGACTTCTATTACCTCTTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCGTTATGGATGCAGGGTCCAGCTGGGCGGATCTGATCAACTAGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCGTTATGGATGCAGGGTCCAGCTGGGCGGATCTGATCAACTAGGCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCATGTCCGGATATGAGTTCATCAACAA         GTTGACTGGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100751 ATCATGTCCGGATATGAGTTCATCAACAAGTA...TAGGTTGACTGGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGATGTATTTGGAATCACCGTTCCTCTAATTACAAGTACAACTGGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101802 AGATGTATTTGGAATCACCGTTCCTCTAATTACAAGTACAACTGGAGCAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGCTGGGAAAGTCTGCTGGCAACGCTGTTTGGCTAAACAGAGATAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101852 AGCTGGGAAAGTCTGCTGGCAACGCTGTTTGGCTAAACAGAGATAAGACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCTCCATTTGAATTGTATCAATTCTTTGTCAGGCAACCGGACGATTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101902 TCTCCATTTGAATTGTATCAATTCTTTGTCAGGCAACCGGACGATTCAGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GGAAAG         GTACCTGAAGCTGTTCACTTTCCTGCCCCTTCCAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101952 GGAAAGGTG...AAGGTACCTGAAGCTGTTCACTTTCCTGCCCCTTCCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGATTGATCATATCATGCAGCTGCATGTCAAAGAGCCAGAAAGGCGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105036 AGATTGATCATATCATGCAGCTGCATGTCAAAGAGCCAGAAAGGCGGGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CCTCAGAAACGACTGGCAGCAGAAGTAACAAAGCTTGTTCATGGACGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105086 CCTCAGAAACGACTGGCAGCAGAAGTAACAAAGCTTGTTCATGGACGAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AGGATTGGATTCTGCTAAAAG         GTGTACACAAGCCCTTTATC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105136 AGGATTGGATTCTGCTAAAAGGTA...CAGGTGTACACAAGCCCTTTATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 ACAGTAGCATAGATGCACTGGAGGTCATGTCTGATCAGGAGTTAAAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105788 ACAGTAGCATAGATGCACTGGAGGTCATGTCTGATCAGGAGTTAAAAGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 TTGTTTAAAGAAGCTCCATTTTCTGAATTTTTTCTCGATCCTGGAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105838 TTGTTTAAAGAAGCTCCATTTTCTGAATTTTTTCTCGATCCTGGAACAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TGTCCTAGATACTTGCCGCAAAGCAAATGCCATTCCAGATGGTCCCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105888 TGTCCTAGATACTTGCCGCAAAGCAAATGCCATTCCAGATGGTCCCCGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 G         GTATCGAATGATAACAGAAGGCGGAGTCAGCATAAATCAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105938 GGTA...TAGGTATCGAATGATAACAGAAGGCGGAGTCAGCATAAATCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CAACAAGTAACAAATCCTGAGAGTGTTTTAATTGTTGGACAACATATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108552 CAACAAGTAACAAATCCTGAGAGTGTTTTAATTGTTGGACAACATATTCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CAAGAATGGACTTTCCTTACTTAAAATAGGAAAAAGAAATTTCTACATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108602 CAAGAATGGACTTTCCTTACTTAAAATAGGAAAAAGAAATTTCTACATTA

   1450     .    :    .
   1415 TAAAATGGCTTCAGTTG
        |||||||||||||||||
 108652 TAAAATGGCTTCAGTTG