seq1 = pF1KE5601.tfa, 1452 bp
seq2 = pF1KE5601/gi568815587r_66463936.tfa (gi568815587r:66463936_66668486), 204551 bp

>pF1KE5601 1452
>gi568815587r:66463936_66668486 (Chr11)

(complement)

1-213  (100001-100213)   100% ->
214-312  (100405-100503)   98% ->
313-531  (100825-101043)   100% ->
532-607  (101166-101241)   100% ->
608-721  (102083-102196)   100% ->
722-867  (102320-102465)   99% ->
868-964  (102560-102656)   100% ->
965-1045  (102736-102816)   100% ->
1046-1165  (103481-103600)   100% ->
1166-1230  (103681-103745)   100% ->
1231-1321  (103839-103929)   100% ->
1322-1380  (104341-104399)   100% ->
1381-1452  (104480-104551)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCCCTGGCTGCAGCTCCTGTCGCTGCTGGGGCTGCTCCCGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCCCTGGCTGCAGCTCCTGTCGCTGCTGGGGCTGCTCCCGGGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTGGCCGCCCCCGCCCAGCCCCGAGCCGCCAGCTTTCAGGCCTGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTGGCCGCCCCCGCCCAGCCCCGAGCCGCCAGCTTTCAGGCCTGGGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCGTCCCCGGAGCTGCTGGCGCCCACCCGCTTCGCGCTGGAGATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCGTCCCCGGAGCTGCTGGCGCCCACCCGCTTCGCGCTGGAGATGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACCGCGGCCGGGCTGCGGGGACGCGGGCCGTGCTGGGCCTTGTGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACCGCGGCCGGGCTGCGGGGACGCGGGCCGTGCTGGGCCTTGTGCGCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCGTCCGCCGG         GCGGGCCAGGGGTCGCTGTACTCCCTGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||| ||||||||||||||||||||||
 100201 CCGCGTCCGCCGGGTG...CAGGCGGGTCAGGGGTCGCTGTACTCCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGCCACCCTGGAGGAGCCACCCTGCAACGACCCCATGGTGTGCCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100433 AGGCCACCCTGGAGGAGCCACCCTGCAACGACCCCATGGTGTGCCGGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCGTGTCCAAGAAAACCCTG         CTCTGCAGCTTCCAAGTCCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100483 CCCGTGTCCAAGAAAACCCTGGTG...CAGCTCTGCAGCTTCCAAGTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGATGAGCTCGGAAGACACGTGCTGCTGCGGAAGGACTGTGGCCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100845 GGATGAGCTCGGAAGACACGTGCTGCTGCGGAAGGACTGTGGCCCAGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACACCAAGGTTCCAGGTGCTGGGGAGCCCAAGTCAGCCTTCACTCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100895 ACACCAAGGTTCCAGGTGCTGGGGAGCCCAAGTCAGCCTTCACTCAGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCAGCCATGATTTCTTCTCTGTCCCAAAACCATCCAGACAACAGAAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100945 TCAGCCATGATTTCTTCTCTGTCCCAAAACCATCCAGACAACAGAAACGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GACTTTCAGCTCAGTCATTTCCCTGTTGAATGAGGATCCCCTGTCCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100995 GACTTTCAGCTCAGTCATTTCCCTGTTGAATGAGGATCCCCTGTCCCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    532         GACTTGCCTGTGAAGATGGCTTCAATCTTCAAGAACTTTGTC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101045 TG...CAGGACTTGCCTGTGAAGATGGCTTCAATCTTCAAGAACTTTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATTACCTATAACCGGACATATGAGTCAAAGGAAG         AAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101208 ATTACCTATAACCGGACATATGAGTCAAAGGAAGGTG...CAGAAGCCCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTGGCGCCTGTCCGTCTTTGTCAATAACATGGTGCGAGCACAGAAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102090 GTGGCGCCTGTCCGTCTTTGTCAATAACATGGTGCGAGCACAGAAGATCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGGCCCTGGACCGTGGCACAGCTCAGTATGGAGTCACCAAGTTCAGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102140 AGGCCCTGGACCGTGGCACAGCTCAGTATGGAGTCACCAAGTTCAGTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTCACAG         AGGAGGAGTTCCGCACTATCTACCTGAATACTCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102190 CTCACAGGTA...CAGAGGAGGAGTTCCGCACTATCTACCTGAATACTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTGAGAAAAGAGCCTGGCAACAAGATGAAGCAAGCCAAGTCTGTGGGTG
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102354 CCTGAGGAAAGAGCCTGGCAACAAGATGAAGCAAGCCAAGTCTGTGGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACCTCGCCCCACCTGAATGGGACTGGAGGAGTAAGGGGGCTGTCACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102404 ACCTCGCCCCACCTGAATGGGACTGGAGGAGTAAGGGGGCTGTCACAAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTCAAAGACCAG         GGCATGTGTGGCTCCTGCTGGGCCTTCTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 102454 GTCAAAGACCAGGTT...TAGGGCATGTGTGGCTCCTGCTGGGCCTTCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGTCACAGGCAATGTGGAGGGCCAGTGGTTTCTCAACCAGGGGACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102589 AGTCACAGGCAATGTGGAGGGCCAGTGGTTTCTCAACCAGGGGACCCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCTCCCTCTCTGAACAGG         AGCTCTTGGACTGTGACAAGATG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102639 TCTCCCTCTCTGAACAGGGTG...TAGAGCTCTTGGACTGTGACAAGATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GACAAGGCCTGCATGGGCGGCTTGCCCTCCAATGCCTACTCGGCCATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102759 GACAAGGCCTGCATGGGCGGCTTGCCCTCCAATGCCTACTCGGCCATAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GAATTTGG         GAGGGCTGGAGACAGAGGATGACTACAGCTACC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102809 GAATTTGGGTA...CAGGAGGGCTGGAGACAGAGGATGACTACAGCTACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 AGGGTCACATGCAGTCCTGCAACTTCTCAGCAGAGAAGGCCAAGGTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103514 AGGGTCACATGCAGTCCTGCAACTTCTCAGCAGAGAAGGCCAAGGTCTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ATCAATGACTCCGTGGAGCTGAGCCAGAACGAGCAGA         AGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 103564 ATCAATGACTCCGTGGAGCTGAGCCAGAACGAGCAGAGTG...CAGAGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGCAGCCTGGCTGGCCAAGAGAGGCCCAATCTCCGTGGCCATCAATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103685 GGCAGCCTGGCTGGCCAAGAGAGGCCCAATCTCCGTGGCCATCAATGCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TTGGCATGCAG         TTTTACCGCCACGGGATCTCCCGCCCTCTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103735 TTGGCATGCAGGTG...CAGTTTTACCGCCACGGGATCTCCCGCCCTCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 CGGCCCCTCTGCAGCCCTTGGCTCATTGACCATGCGGTGTTGCTTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103869 CGGCCCCTCTGCAGCCCTTGGCTCATTGACCATGCGGTGTTGCTTGTGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTACGGCAACC         GCTCTGACGTTCCCTTTTGGGCCATCAAGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103919 CTACGGCAACCGTG...CAGGCTCTGACGTTCCCTTTTGGGCCATCAAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 ACAGCTGGGGCACTGACTGGGGTGAGAAG         GGTTACTACTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104371 ACAGCTGGGGCACTGACTGGGGTGAGAAGGTG...CAGGGTTACTACTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 TTGCATCGCGGGTCCGGGGCCTGTGGCGTGAACACCATGGCCAGCTCGGC
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104492 TTGCATCGTGGGTCCGGGGCCTGTGGCGTGAACACCATGGCCAGCTCGGC

   1550     .    :
   1443 GGTGGTGGAC
        ||||||||||
 104542 GGTGGTGGAC