seq1 = pF1KE5584.tfa, 1095 bp
seq2 = pF1KE5584/gi568815587r_5902054.tfa (gi568815587r:5902054_6103148), 201095 bp

>pF1KE5584 1095
>gi568815587r:5902054_6103148 (Chr11)

(complement)

1-1095  (100001-101095)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGACAGTGATTTTAAAAACTTTATTGGGACAGATACAGGGCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGACAGTGATTTTAAAAACTTTATTGGGACAGATACAGGGCCTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAAACCCACACTCTACTACGTCTAGAATGTACTTTTTATGTTTCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAAACCCACACTCTACTACGTCTAGAATGTACTTTTTATGTTTCTGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTCTCTACTACGTTTTAAGGTACACTGGGTCTCCAGATTGATCAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTCTCTACTACGTTTTAAGGTACACTGGGTCTCCAGATTGATCAGGAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTTTACATGGCATCTCCCAGCAATGACTCCACTGCCCCAGTCTCTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTTTACATGGCATCTCCCAGCAATGACTCCACTGCCCCAGTCTCTGAATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCCTCATCTGCTTCCCCAACTTCCAGAGCTGGCAGCACTGGTTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCCTCATCTGCTTCCCCAACTTCCAGAGCTGGCAGCACTGGTTGTCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCCCCTCAGCCTTCTCTTCCTCCTGGCCATGGGAGCTAACACCACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCCCCTCAGCCTTCTCTTCCTCCTGGCCATGGGAGCTAACACCACCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGATCACCATCCAGCTGGAGGCCTCTCTGCACCAGCCCCTGTACTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGATCACCATCCAGCTGGAGGCCTCTCTGCACCAGCCCCTGTACTACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTCAGCCTCCTCTCCCTGCTGGACATCGTGCTCTGCCTCACCGTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTCAGCCTCCTCTCCCTGCTGGACATCGTGCTCTGCCTCACCGTCATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCAAGGTCCTGGCCATCTTCTGGTTTGACCTCAGGTCGATCAGCTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCAAGGTCCTGGCCATCTTCTGGTTTGACCTCAGGTCGATCAGCTTCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCTGCTTCCTCCAGATGTTCATCATGAACAGTTTTTTGACCATGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCTGCTTCCTCCAGATGTTCATCATGAACAGTTTTTTGACCATGGAGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCACGTTCATGGTCATGGCCTATGACCGTTATGTGGCCATCTGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGCACGTTCATGGTCATGGCCTATGACCGTTATGTGGCCATCTGCCATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CATTGAGATACCCGTCTATCATCACTGACCAGTTTGTGGCTAGGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CATTGAGATACCCGTCTATCATCACTGACCAGTTTGTGGCTAGGGCCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTCTTTGTTATAGCCCGGAATGCCTTTGTTTCTCTTCCTGTTCCCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTCTTTGTTATAGCCCGGAATGCCTTTGTTTCTCTTCCTGTTCCCATGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTCTGCCAGGCTCAGATACTGTGCAGGAAACATAATCAAGAACTGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTCTGCCAGGCTCAGATACTGTGCAGGAAACATAATCAAGAACTGCATCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCAGTAACCTGTCTGTGTCCAAACTCTCTTGTGATGACATCACTTTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCAGTAACCTGTCTGTGTCCAAACTCTCTTGTGATGACATCACTTTCAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CAGCTCTACCAGTTTGTGGCAGGCTGGACTCTGTTGGGCTCTGATCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CAGCTCTACCAGTTTGTGGCAGGCTGGACTCTGTTGGGCTCTGATCTTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTTATTGTTATCTCCTATTCTTTTATATTGAAAGTTGTGCTTAGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTTATTGTTATCTCCTATTCTTTTATATTGAAAGTTGTGCTTAGGATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGGCCGAGGGTGCTGTGGCCAAGGCCTTGAGCACGTGTGGTTCCCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGGCCGAGGGTGCTGTGGCCAAGGCCTTGAGCACGTGTGGTTCCCACTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATCCTCATCCTCTTCTTCAGCACAGTCCTGCTGGTTCTGGTCATCACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATCCTCATCCTCTTCTTCAGCACAGTCCTGCTGGTTCTGGTCATCACTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCTGGCCAGGAAGAGAATTCCTCCAGATGTCCCCATCCTGCTCAACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCTGGCCAGGAAGAGAATTCCTCCAGATGTCCCCATCCTGCTCAACATCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGCACCACCTCATTCCCCCAGCTCTGAACCCCATTGTTTATGGTGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCACCACCTCATTCCCCCAGCTCTGAACCCCATTGTTTATGGTGTGAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1051 ACCAAGGAGATCAAGCAGGGAATCCAAAACCTGCTGAAGAGGTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ACCAAGGAGATCAAGCAGGGAATCCAAAACCTGCTGAAGAGGTTG