seq1 = pF1KE5579.tfa, 1065 bp
seq2 = pF1KE5579/gi568815575r_13218870.tfa (gi568815575r:13218870_13419934), 201065 bp

>pF1KE5579 1065
>gi568815575r:13218870_13419934 (ChrX)

(complement)

1-1065  (100001-101065)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTTCATCTTTCATGAGAAACAGGAAGGTTTCCTGTGTGCTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATTTCATCTTTCATGAGAAACAGGAAGGTTTCCTGTGTGCTCAGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTCTGAACAATCTATTGCAAGGAGAATATTTTAGCCCTGTGGAATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTCTGAACAATCTATTGCAAGGAGAATATTTTAGCCCTGTGGAATTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCAATTGCACATCAGCTAGATGAAGAAGAGAGGATGAGAATGGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCAATTGCACATCAGCTAGATGAAGAAGAGAGGATGAGAATGGCAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGAGGAGTCACCAGTGAAGAGTATCTTGCATTTTTACAGCAGCCTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGAGGAGTCACCAGTGAAGAGTATCTTGCATTTTTACAGCAGCCTTCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAACATGGATGATACCGGTTTCTTCTCCATTCAGGTAATAAGCAATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAACATGGATGATACCGGTTTCTTCTCCATTCAGGTAATAAGCAATGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAAGTTCTGGGGTTTAGAGATCATCCATTTCAATAATCCTGAATATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGAAGTTCTGGGGTTTAGAGATCATCCATTTCAATAATCCTGAATATCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGCTCGGCATTGATCCTATAAATGAAAGATCTTTTATATGTAATTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGCTCGGCATTGATCCTATAAATGAAAGATCTTTTATATGTAATTATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACAACACTGGTTTACTATTAGAAAATTTGGAAAACACTGGTTTAACTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACAACACTGGTTTACTATTAGAAAATTTGGAAAACACTGGTTTAACTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATTCTCTCTTGGCGGGTCCAGAATTAATATCAGATACATGCCTTGCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATTCTCTCTTGGCGGGTCCAGAATTAATATCAGATACATGCCTTGCAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCTTGGCTCGATTACAACAACAAGCATATTCTGTATTTGTTGTCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCTTGGCTCGATTACAACAACAAGCATATTCTGTATTTGTTGTCAAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGATCTGCCAGACTGTGAAGCTGACCAACTCCTGCAGATCATCAGTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGATCTGCCAGACTGTGAAGCTGACCAACTCCTGCAGATCATCAGTGTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGAGATGGATACACCAAAACTTAATGGAAAAAAATTAGTAAAACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGAGATGGATACACCAAAACTTAATGGAAAAAAATTAGTAAAACAAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGCATAGAGTCTATAAAACAGTCCTTGAAAAAGTATCAGAAGAAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGCATAGAGTCTATAAAACAGTCCTTGAAAAAGTATCAGAAGAAAGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGAGTCTGGAACATCAGACCAAGATGAGGAGGATTTTCAGAGGGCCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGAGTCTGGAACATCAGACCAAGATGAGGAGGATTTTCAGAGGGCCCTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AACTAAGCCGCCAAGAAACCAATAGAGAAGATGAACATCTCCGCAGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AACTAAGCCGCCAAGAAACCAATAGAGAAGATGAACATCTCCGCAGTACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATTGAGTTAAGCATGCAAGGTAGTTCCGGAAACACATCGCAAGATCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATTGAGTTAAGCATGCAAGGTAGTTCCGGAAACACATCGCAAGATCTTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AAAGACATCATGTGTAACTCCTGCTTCAGAACAGCCGAAGAAAATAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAAGACATCATGTGTAACTCCTGCTTCAGAACAGCCGAAGAAAATAAAAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AAGACTATTTTGAAAAGCATCAGCAGGAACAGAAGCAGCAGCAACAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AAGACTATTTTGAAAAGCATCAGCAGGAACAGAAGCAGCAGCAACAACAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCAGATCTGCCGGGCCACAGTTCATACCTACACGAAAGGCCAACAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCAGATCTGCCGGGCCACAGTTCATACCTACACGAAAGGCCAACAACAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TTCGAGAGCAATTGAGAGTGATCTCAGTGATGACATCAGTGAAGGCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TTCGAGAGCAATTGAGAGTGATCTCAGTGATGACATCAGTGAAGGCACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TACAGGCCGCTGTCGACACCATTTTAGAAATTATGAGAAAGAATTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TACAGGCCGCTGTCGACACCATTTTAGAAATTATGAGAAAGAATTTGAAA

   1050     .    :    .
   1051 ATCAAAGGGGAAAAA
        |||||||||||||||
 101051 ATCAAAGGGGAAAAA