seq1 = pF1KE5486.tfa, 1017 bp
seq2 = pF1KE5486/gi568815579f_9151076.tfa (gi568815579f:9151076_9352060), 200985 bp

>pF1KE5486 1017
>gi568815579f:9151076_9352060 (Chr19)

1-1017  (99969-100985)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTATTTTCCAATTCTCTTTTTTTTTTTCCTCAAAAGGTGTCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99969 ATGTCCTATTTTCCAATTCTCTTTTTTTTTTTCCTCAAAAGGTGTCCGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACACAGAGCCACAGAATCTCACAGGTGTCTCAGAATTCCTCCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100019 CTACACAGAGCCACAGAATCTCACAGGTGTCTCAGAATTCCTCCTCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACTCTCAGAGGATCCAGAACTGCAGCCGGTCCTCGCTGGGCTGTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100069 GACTCTCAGAGGATCCAGAACTGCAGCCGGTCCTCGCTGGGCTGTTCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCATGTACCTGGTCACGGTGCTGGGGAACCTGCTCATCATCCTGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100119 TCCATGTACCTGGTCACGGTGCTGGGGAACCTGCTCATCATCCTGGCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCTCTGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCTTCCTCTCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100169 CAGCTCTGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCTTCCTCTCCAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTCCTTGGCTGACATCGGTTTCACCTCCACCACGGTCCCCAAGATGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100219 TGTCCTTGGCTGACATCGGTTTCACCTCCACCACGGTCCCCAAGATGATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGGACATGCAAACTCACAGCAGAGTCATCTCCTATGAAGGCTGCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100269 GTGGACATGCAAACTCACAGCAGAGTCATCTCCTATGAAGGCTGCCTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCAGATGTCTTTTTTTGTCCTTTTTGCATGTATGGATGACATGCTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100319 TCAGATGTCTTTTTTTGTCCTTTTTGCATGTATGGATGACATGCTCCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGTGATGGCCTATGACCGGTTTGTGGCCATCTGTCACCCCCTGCACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100369 GTGTGATGGCCTATGACCGGTTTGTGGCCATCTGTCACCCCCTGCACTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGAATCATCATGAACCCACGCCTCTGTGGCTTCTTAATCTTGTTGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100419 CGAATCATCATGAACCCACGCCTCTGTGGCTTCTTAATCTTGTTGTCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTTATTAGTCTTTTGGACTCCCAGTTGCACAATTTGATTATGTTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100469 TTTTATTAGTCTTTTGGACTCCCAGTTGCACAATTTGATTATGTTACAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCACCTGCTTCAAGGATGTGGACATTTCTAATTTCTTCTGTGACCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100519 TCACCTGCTTCAAGGATGTGGACATTTCTAATTTCTTCTGTGACCCTTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAACTCCTCCACCTTAGGTGTTCCGACACCTTCATCAATGAAATGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100569 CAACTCCTCCACCTTAGGTGTTCCGACACCTTCATCAATGAAATGGTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATATTTCATGGGTGCCATATTTGGCTGTCTCCCTATCTCAGGGATCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100619 ATATTTCATGGGTGCCATATTTGGCTGTCTCCCTATCTCAGGGATCCTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCTCTTACTATAAAATTGTTTCCCCCATTCTGAGAGTTCCAACATCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100669 TCTCTTACTATAAAATTGTTTCCCCCATTCTGAGAGTTCCAACATCAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGAAGTATAAAGCCTTCTCCACCTGTGGCTCTCACCTGGCAGTTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100719 GGGAAGTATAAAGCCTTCTCCACCTGTGGCTCTCACCTGGCAGTTGTTTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTTATTTTATGGAACAGGGCTTGTAGGGTACCTCAGTTCAGCTGTGTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100769 CTTATTTTATGGAACAGGGCTTGTAGGGTACCTCAGTTCAGCTGTGTTAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CATCCCCCAGGAAGAGTATGGTGGCTTCAGTGATGTACACTGTGGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100819 CATCCCCCAGGAAGAGTATGGTGGCTTCAGTGATGTACACTGTGGTCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCATGCTGAACCCCTTCATCTACAGCCTGAGGAACAAGGACATTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100869 CCCATGCTGAACCCCTTCATCTACAGCCTGAGGAACAAGGACATTCAAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGCCCTGTGCAGGCTGCATGGCAGAATCATCAAATCTCATCATCTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100919 TGCCCTGTGCAGGCTGCATGGCAGAATCATCAAATCTCATCATCTCCATC

   1000     .    :    .
   1001 CTTTTTGTTATATGGGA
        |||||||||||||||||
 100969 CTTTTTGTTATATGGGA