seq1 = pF1KE5473.tfa, 981 bp
seq2 = pF1KE5473/gi568815587r_56642831.tfa (gi568815587r:56642831_56843811), 200981 bp

>pF1KE5473 981
>gi568815587r:56642831_56843811 (Chr11)

(complement)

1-981  (100001-100981)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTTTCCCTTCTCATGATAGTCAGGCTTTCACCTCCGTGGACATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTTTCCCTTCTCATGATAGTCAGGCTTTCACCTCCGTGGACATGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTGGGAAATTGCACCATCCTGACTGAATTCATCTTGTTGGGTTTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTGGGAAATTGCACCATCCTGACTGAATTCATCTTGTTGGGTTTCTCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGATTCCCAGTGGCAGCCGATTCTATTTGGAGTGTTTCTGATGCTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGATTCCCAGTGGCAGCCGATTCTATTTGGAGTGTTTCTGATGCTCTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGATAACCTTGTCAGGAAACATGACCTTGGTTATCTTAATCCGAACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGATAACCTTGTCAGGAAACATGACCTTGGTTATCTTAATCCGAACTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCCCACTTGCATACACCTATGTACTTTTTCATTGGCAATCTGTCTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCCCACTTGCATACACCTATGTACTTTTTCATTGGCAATCTGTCTTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGATTTCTGGTATACCTCTGTGTATACCCCCAAAATCCTGGCCAGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGATTTCTGGTATACCTCTGTGTATACCCCCAAAATCCTGGCCAGTTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCTCAGAAGATAAGCGCATTTCCTTGGCTGGATGTGGGGCTCAGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTCTCAGAAGATAAGCGCATTTCCTTGGCTGGATGTGGGGCTCAGCTGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTTTCCTGTGTTGTAGCCTACACTGAATGCTATCTCCTGGCAGCCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTTTCCTGTGTTGTAGCCTACACTGAATGCTATCTCCTGGCAGCCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CATATGACCGCCATGCAGCAATTTGTAACCCATTGCTTTATTCAGGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CATATGACCGCCATGCAGCAATTTGTAACCCATTGCTTTATTCAGGTACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGTCCACCGCCCTCTGTACTGGGCTTGTTGCTGGCTCCTACATAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGTCCACCGCCCTCTGTACTGGGCTTGTTGCTGGCTCCTACATAGGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTTTTGAATGCCATAGCCCATACTGCCAATACATTCCGCCTGCATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTTTTGAATGCCATAGCCCATACTGCCAATACATTCCGCCTGCATTTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGGTAAAAATATCATTGACCACTTTTTCTGTGATGCACCACCATTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTGGTAAAAATATCATTGACCACTTTTTCTGTGATGCACCACCATTGGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAAATGTCCTGTACAGACACCAGGGTCTACGAAAAAGTCCTGCTTGGTGT
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAAATGTCCTGTACAAACACCAGGGTCTACGAAAAAGTCCTGCTTGGTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGTGGGCTTCACAGTACTCTCCAGCATTCTTGCTATCCTGATTTCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGTGGGCTTCACAGTACTCTCCAGCATTCTTGCTATCCTGATTTCCTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCAACATCCTCCTGGCTATCCTGAGAATCCACTCAGCTTCAGGAAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCAACATCCTCCTGGCTATCCTGAGAATCCACTCAGCTTCAGGAAGACAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGGCATTCTCCACCTGTGCTTCCCACCTCATCTCAGTCATGCTCTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGGCATTCTCCACCTGTGCTTCCCACCTCATCTCAGTCATGCTCTTCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGGATCATTGTTGTTTATGTATTCAAGGCCTAGTTCCACCTACTCCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGATCATTGTTGTTTATGTATTCAAGGCCTAGTTCCACCTACTCCCTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGAGGGACAAAGTAGCTGCTCTGTTCTACACCGTGATCAACCCACTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGAGGGACAAAGTAGCTGCTCTGTTCTACACCGTGATCAACCCACTGCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACCCTCTCATCTATAGCCTGAGAAACAAAGATATCAAAGAGGCCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACCCTCTCATCTATAGCCTGAGAAACAAAGATATCAAAGAGGCCTTCAG

    950     .    :    .    :    .    :
    951 GAAAGCAACACAGACTATACAACCACAAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAAAGCAACACAGACTATACAACCACAAACA