seq1 = pF1KE5469.tfa, 954 bp
seq2 = pF1KE5469/gi568815591r_17926829.tfa (gi568815591r:17926829_18127780), 200952 bp

>pF1KE5469 954
>gi568815591r:17926829_18127780 (Chr7)

(complement)

1-954  (99999-100952)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGAATATCAAAATCTTCAGCGGCAGCTCCCACCAGGACTTATCCCA
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 ACGCCGAATATCAAAATCTTCAGCGGCAGCTCCCACCAGGACTTATCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAAATTGCTGACCGCCTGGGCCTGGAGCTAGGCAAGGTGGTGACTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 GAAAATTGCTGACCGCCTGGGCCTGGAGCTAGGCAAGGTGGTGACTAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AATTCAGCAACCAGGAGACCTGCGTGGAAATTGATGAGAGTGTGCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 AATTCAGCAACCAGGAGACCTGCGTGGAAATTGATGAGAGTGTGCGTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGATGTCTACATCGTTCAGAGTGGTTGTGGCGAAATCAACGACAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 GAGGATGTCTACATCGTTCAGAGTGGTTGTGGCGAAATCAACGACAGTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AATGGAGCTTTTGATCATGATTAATGCCTGCAAGATTGCTTCAGCTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100199 AATGGAGCTTTTGATCATGATTAATGCCTGCAAGATTGCTTCAGCTAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGTTACTGCAGTCATCCCATGCTTCCCTTATGCCCGACAGGATAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100249 GAGTTACTGCAGTCATCCCATGCTTCCCTTATGCCCGACAGGATAAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATAAGAGCCGGTCCCCAATCTCTGCCAAGCTTGTTGCAAATATGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100299 GATAAGAGCCGGTCCCCAATCTCTGCCAAGCTTGTTGCAAATATGCTCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TATAGCAGGTGCGGATCATATCATCACCATGGACCTACATGCTTCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100349 TATAGCAGGTGCGGATCATATCATCACCATGGACCTACATGCTTCTCAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTCAGGGCTTTTTTGATATCCCAGTAGACAACTTGTATGCAGAGCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100399 TTCAGGGCTTTTTTGATATCCCAGTAGACAACTTGTATGCAGAGCCAACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCCTGAAGTGGATAAGGGAGAATATCCCTGAGTGGAAGAACTGCATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100449 GTCCTGAAGTGGATAAGGGAGAATATCCCTGAGTGGAAGAACTGCATTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTCTCGCCAGATGCTGGTGGAGCTAAAAGAGTGACCTCCATTGCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100499 TGTCTCGCCAGATGCTGGTGGAGCTAAAAGAGTGACCTCCATTGCAGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGTTGAATGTGGACTTTGCTTTGATTCATAAAGAACGGAAGAAGGCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100549 AGTTGAATGTGGACTTTGCTTTGATTCATAAAGAACGGAAGAAGGCCAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAAGTGGACTGCATAGTGCTAGTGGGAGATGTGAATGATCGTGTGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100599 GAAGTGGACTGCATAGTGCTAGTGGGAGATGTGAATGATCGTGTGGCTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTTGTAGATGACATGGCAGACACTTGTGTTACAATCTGCCTCGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100649 CCTTGTAGATGACATGGCAGACACTTGTGTTACAATCTGCCTCGCAGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACAAACTTCTCTCAGCTGGAGCAACCAGAGTTTATGCTATCTTGACTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100699 ACAAACTTCTCTCAGCTGGAGCAACCAGAGTTTATGCTATCTTGACTCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGAATCTTTTCTGGCCCAGCCATTTCTCGCATCAACACTGCATGCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100749 GGAATCTTTTCTGGCCCAGCCATTTCTCGCATCAACACTGCATGCTTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGCAGTGGTAGTCACCAATACCATACCTCAAGATGAGAAGATGAAGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100799 AGCAGTGGTAGTCACCAATACCATACCTCAAGATGAGAAGATGAAGCATT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCTCCAAAATACGAGTAATTGACATCTCCATGATCCTTGCAGAAGCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100849 GCTCCAAAATACGAGTAATTGACATCTCCATGATCCTTGCAGAAGCCATA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGGAGAACTCATAATGGGGAATCTGTTTCCTACCTGTTCAGCCATGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100899 AGGAGAACTCATAATGGGGAATCTGTTTCCTACCTGTTCAGCCATGTTCC

    950 
    951 TTTA
        ||||
 100949 TTTA