seq1 = pF1KE5468.tfa, 948 bp
seq2 = pF1KE5468/gi568815591f_141664159.tfa (gi568815591f:141664159_141865106), 200948 bp

>pF1KE5468 948
>gi568815591f:141664159_141865106 (Chr7)

1-948  (100001-100948)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGGACTCACCGAGGGGGTGTTCCTGATTCTGTCTGGCACTCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGGACTCACCGAGGGGGTGTTCCTGATTCTGTCTGGCACTCAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACACTGGGAATTCTGGTCAATTGTTTCATTGAGTTGGTCAATGGTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACACTGGGAATTCTGGTCAATTGTTTCATTGAGTTGGTCAATGGTAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTGGTTCAAGACCAAGAGAATGTCTTTGTCTGACTTCATCATCACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTGGTTCAAGACCAAGAGAATGTCTTTGTCTGACTTCATCATCACCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCACTCTTGAGGATCATTCTGCTGTGTATTATCTTGACTGATAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCACTCTTGAGGATCATTCTGCTGTGTATTATCTTGACTGATAGTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTAATAGAATTCTCTCCCAACACACATGATTCAGGGATAATAATGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTAATAGAATTCTCTCCCAACACACATGATTCAGGGATAATAATGCAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTATTGATGTTTCCTGGACATTTACAAACCATCTGAGCATTTGGCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTATTGATGTTTCCTGGACATTTACAAACCATCTGAGCATTTGGCTTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCTGTCTTGGTGTCCTCTACTGCCTGAAAATCGCCAGTTTCTCTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCTGTCTTGGTGTCCTCTACTGCCTGAAAATCGCCAGTTTCTCTCACCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACATTCCTCTGGCTCAAGTGGAGAGTTTCTAGGGTGATGGTATGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACATTCCTCTGGCTCAAGTGGAGAGTTTCTAGGGTGATGGTATGGATGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTTGGGTGCACTGCTCTTATCCTGTGGTAGTACCGCATCTCTGATCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGTTGGGTGCACTGCTCTTATCCTGTGGTAGTACCGCATCTCTGATCAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGTTTAAGCTCTATTCTGTCTTTAGGGGAATTGAGGCCACCAGGAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGTTTAAGCTCTATTCTGTCTTTAGGGGAATTGAGGCCACCAGGAATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GACTGAACACTTCAGAAAGAAGAGGAGTGAGTATTATCTGATCCATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GACTGAACACTTCAGAAAGAAGAGGAGTGAGTATTATCTGATCCATGTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGGGACTCTGTGGTACCTGCCTCCCTTAATTGTGTCCCTGGCCTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGGGACTCTGTGGTACCTGCCTCCCTTAATTGTGTCCCTGGCCTCCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTTTGCTCATCTTCTCCCTGGGGAGGCACACACGGCAGATGCTGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTTTGCTCATCTTCTCCCTGGGGAGGCACACACGGCAGATGCTGCAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGGACAAGCTCCAGAGATCCAACCACTGAGGCCCACAAGAGGGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGGGACAAGCTCCAGAGATCCAACCACTGAGGCCCACAAGAGGGCCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAATCATCCTTTCCTTCTTCTTTCTCTTCTTACTTTACTTTCTTGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GAATCATCCTTTCCTTCTTCTTTCTCTTCTTACTTTACTTTCTTGCTTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTAATTGCATCATTTGGTAATTTCCTACCAAAAACCAAGATGGCTAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTAATTGCATCATTTGGTAATTTCCTACCAAAAACCAAGATGGCTAAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATTGGCGAAGTAATGACAATGTTTTATCCTGCTGGCCACTCATTTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATTGGCGAAGTAATGACAATGTTTTATCCTGCTGGCCACTCATTTATTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCATTCTGGGGAACAGTAAGCTGAAGCAGACATTTGTAGTGATGCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCATTCTGGGGAACAGTAAGCTGAAGCAGACATTTGTAGTGATGCTCCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    901 TGTGAGTCTGGTCATCTGAAGCCTGGATCCAAGGGACCCATTTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGTGAGTCTGGTCATCTGAAGCCTGGATCCAAGGGACCCATTTTCTCT