seq1 = pF1KE5465.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5465/gi568815587r_55503444.tfa (gi568815587r:55503444_55704373), 200930 bp

>pF1KE5465 930
>gi568815587r:55503444_55704373 (Chr11)

(complement)

1-930  (100001-100930)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCAAAATAACAGTGTGCCTGAATTCATACTGTTAGGATTAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCAAAATAACAGTGTGCCTGAATTCATACTGTTAGGATTAACACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGATCCCTTGAGGCAGAAAATAGTGTTTGTAATCTTCTTAATTTTCTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGATCCCTTGAGGCAGAAAATAGTGTTTGTAATCTTCTTAATTTTCTATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGGAACTGTGGTGGGGAATATGCTCATTATTGTGACCATCAAGTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGGAACTGTGGTGGGGAATATGCTCATTATTGTGACCATCAAGTCCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGACACTAGGAAGCCCCATGTACTTCTTTCTATTTTATTTGTCCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGACACTAGGAAGCCCCATGTACTTCTTTCTATTTTATTTGTCCTTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGATTCTTGCTTTTCAACTTCCACAGCCCCTAGATTAATTGTGGATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGATTCTTGCTTTTCAACTTCCACAGCCCCTAGATTAATTGTGGATGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTCTGAAAAGAAAATTATAACCTACAATGAGTGCATGACACAAGTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTCTGAAAAGAAAATTATAACCTACAATGAGTGCATGACACAAGTCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCACTACATTTATTTGGCTGCATGGAGATCTTTGTCCTCATTCTCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCACTACATTTATTTGGCTGCATGGAGATCTTTGTCCTCATTCTCATGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTTGATCGCTATGTGGCCATCTGTAAGCCCTTGCGTTACCCAACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTTGATCGCTATGTGGCCATCTGTAAGCCCTTGCGTTACCCAACCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAGCCAGCAGGTCTGCATCATCCTGATTGTTCTTGCCTGGATAGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAGCCAGCAGGTCTGCATCATCCTGATTGTTCTTGCCTGGATAGGGTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTAATACACTCTACAGCTCAGATTATCCTGGCCTTAAGATTGCCTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTAATACACTCTACAGCTCAGATTATCCTGGCCTTAAGATTGCCTTTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGACCCTATTTGATTGATCATTATTGCTGTGATTTGCAGCCCTTGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGACCCTATTTGATTGATCATTATTGCTGTGATTTGCAGCCCTTGTTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AACTTGCCTGTATGGACACTTACATGATCAACCTGCTGTTGGTGTCTAAC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AACTTGCCTGCATGGACACTTACATGATCAACCTGCTGTTGGTGTCTAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGTGGGGCAATTTGCTCAAGTAGTTTCATGATTTTGATAATTTCATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGTGGGGCAATTTGCTCAAGTAGTTTCATGATTTTGATAATTTCATATAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTCATCTTGCATTCACTGAGAAACCACAGTGCCAAAGGGAAGAAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTCATCTTGCATTCACTGAGAAACCACAGTGCCAAAGGGAAGAAAAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTCTCTCCGCTTGCACGTCTCACATAATTGTAGTCATCTTATTCTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTCTCTCCGCTTGCACGTCTCACATAATTGTAGTCATCTTATTCTTTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCATGTATATTCATATATACACGCCCCCCGACCACTTTCCCCATGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCATGTATATTCATATATACACGCCCCCCGACCACTTTCCCCATGGACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATGGTGGCAGTATTTTATACTATTGGAACACCCTTTCTCAATCCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATGGTGGCAGTATTTTATACTATTGGAACACCCTTTCTCAATCCACTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTACACACTGAGGAATGCAGAAGTGAAAAATGCCATGAGAAAGTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCTACACACTGAGGAATGCAGAAGTGAAAAATGCCATGAGAAAGTTATGG

    900     .    :    .    :    .    :
    901 CATGGCAAAATTATTTCAGAAAACAAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CATGGCAAAATTATTTCAGAAAACAAAGGA