seq1 = pF1KE5455.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5455/gi568815592r_131600472.tfa (gi568815592r:131600472_131801401), 200930 bp

>pF1KE5455 930
>gi568815592r:131600472_131801401 (Chr6)

(complement)

1-930  (100001-100930)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGACAATATAACATCCATCAGAGAGTTCCTCCTACTGGGATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGACAATATAACATCCATCAGAGAGTTCCTCCTACTGGGATTTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTTGGCCCAAGGATTCAGATGCTCCTCTTTGGGCTCTTCTCCCTGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGTTGGCCCAAGGATTCAGATGCTCCTCTTTGGGCTCTTCTCCCTGTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGTCTTCACCCTGCTGGGGAACGGGACCATACTGGGGCTCATCTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGTCTTCACCCTGCTGGGGAACGGGACCATACTGGGGCTCATCTCACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACTCCAGACTGCACGCCCCCATGTACTTCTTCCTCTCACACCTGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACTCCAGACTGCACGCCCCCATGTACTTCTTCCTCTCACACCTGGCGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTCGACATCGCCTACGCCTGCAACACGGTGCCCCGGATGCTGGTGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTCGACATCGCCTACGCCTGCAACACGGTGCCCCGGATGCTGGTGAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCTGCATCCAGCCAAGCCCATCTCCTTTGCGGGCCGCATGATGCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCTGCATCCAGCCAAGCCCATCTCCTTTGCGGGCCGCATGATGCAGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTCTGTTTTCCACTTTTGCTGTCACAGAATGTCTCCTCCTGGTGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTCTGTTTTCCACTTTTGCTGTCACAGAATGTCTCCTCCTGGTGGTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCCTATGATCTGTACGTGGCCATCTGCCACCCCCTCCGATATTTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTCCTATGATCTGTACGTGGCCATCTGCCACCCCCTCCGATATTTGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATGACCTGGAGAGTCTGCATCACCCTCGCGGTGACTTCCTGGACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATGACCTGGAGAGTCTGCATCACCCTCGCGGTGACTTCCTGGACCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGAGTCCTTTTATCCTTGATTCATCTTGTGTTACTTCTACCTTTACCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGAGTCCTTTTATCCTTGATTCATCTTGTGTTACTTCTACCTTTACCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGTAGGCCCCAGAAAATTTATCACTTTTTTTGTGAAATCTTGGCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGTAGGCCCCAGAAAATTTATCACTTTTTTTGTGAAATCTTGGCTGTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAAACTTGCCTGTGCAGATACCCACATCAATGAGAACATGGTCTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAAACTTGCCTGTGCAGATACCCACATCAATGAGAACATGGTCTTGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGAGCAATTTCTGGGCTGGTGGGACCCTTGTCCACAATTGTAGTTTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGAGCAATTTCTGGGCTGGTGGGACCCTTGTCCACAATTGTAGTTTCATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TATGTGCATCCTCTGTGCTATCCTTCAGATCCAATCAAGGGAAGTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TATGTGCATCCTCTGTGCTATCCTTCAGATCCAATCAAGGGAAGTTCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAAAGCCTTCCGCACCTGCTTCTCCCACCTCTGTGTGATTGGACTCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAAAGCCTTCCGCACCTGCTTCTCCCACCTCTGTGTGATTGGACTCGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGGCACAGCCATTATCATGTATGTTGGACCCAGATATGGGAACCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGGCACAGCCATTATCATGTATGTTGGACCCAGATATGGGAACCCCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAGCAGAAGAAATATCTCCTGCTGTTTCACAGCCTCTTTAATCCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAGCAGAAGAAATATCTCCTGCTGTTTCACAGCCTCTTTAATCCCATGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCAATCCCCTTATCTGTAGTCTTAGGAACTCAGAAGTGAAGAATACTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCAATCCCCTTATCTGTAGTCTTAGGAACTCAGAAGTGAAGAATACTTTG

    900     .    :    .    :    .    :
    901 AAGAGAGTGCTGGGAGTAGAAAGGGCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGAGAGTGCTGGGAGTAGAAAGGGCTTTA