seq1 = pF1KE5383.tfa, 921 bp
seq2 = pF1KE5383/gi568815586r_10725349.tfa (gi568815586r:10725349_10926269), 200921 bp

>pF1KE5383 921
>gi568815586r:10725349_10926269 (Chr12)

(complement)

1-921  (100001-100921)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTACGTGTAGTGGAAGGCATCTTCATTTTTGTTGTAGTTAGTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTACGTGTAGTGGAAGGCATCTTCATTTTTGTTGTAGTTAGTGAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTGTTTGGGGTTTTGGGGAATGGATTTATTGGACTTGTAAACTGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTGTTTGGGGTTTTGGGGAATGGATTTATTGGACTTGTAAACTGCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGTGCCAAGAATAAGTTATCTACGATTGGCTTTATTCTCACCGGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGTGCCAAGAATAAGTTATCTACGATTGGCTTTATTCTCACCGGCTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTATTTCAAGAATTTTTCTGATATGGATAATAATTACAGATGGATTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTATTTCAAGAATTTTTCTGATATGGATAATAATTACAGATGGATTTAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACAGATATTCTCTCCAAATATATATGCCTCCGGTAACCTAATTGAATATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACAGATATTCTCTCCAAATATATATGCCTCCGGTAACCTAATTGAATATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTAGTTACTTTTGGGTAATTGGTAATCAATCAAGTATGTGGTTTGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTAGTTACTTTTGGGTAATTGGTAATCAATCAAGTATGTGGTTTGCCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCTCAGCATCTTCTATTTCCTGAAGATAGCAAATTTTTCCAACTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCCTCAGCATCTTCTATTTCCTGAAGATAGCAAATTTTTCCAACTACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATTTCTCTGGTTGAAGAGCAGAACAAATATGGTTCTTCCCTTCATGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ATTTCTCTGGTTGAAGAGCAGAACAAATATGGTTCTTCCCTTCATGATAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TATTCTTACTTATTTCATCGTTACTTAATTTTGCATACATTGCGAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TATTCTTACTTATTTCATCGTTACTTAATTTTGCATACATTGCGAAGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTTAATGATTATAAAATGAAGAATGACACAGTCTGGGATCTCAACATGTA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTTAATGATTATAAAACGAAGAATGACACAGTCTGGGATCTCAACATGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TAAAAGTGAATACTTTATTAAACAGATTTTGCTAAATCTGGGAGTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TAAAAGTGAATACTTTATTAAACAGATTTTGCTAAATCTGGGAGTCATTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTTCTTTACACTATCCCTAATTACATGTATTTTTTTAATCATTTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTTCTTTACACTATCCCTAATTACATGTATTTTTTTAATCATTTCCCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGGAGACACAACAGGCAGATGCAATCGAATGTGACAGGATTGAGAGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGGAGACACAACAGGCAGATGCAATCGAATGTGACAGGATTGAGAGACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAACACAGAAGCTCATGTGAAGGCAATGAAAGTTTTGATATCTTTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAACACAGAAGCTCATGTGAAGGCAATGAAAGTTTTGATATCTTTCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTCTTTATCTTGTATTTTATAGGCATGGCCATAGAAATATCATGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTCTTTATCTTGTATTTTATAGGCATGGCCATAGAAATATCATGTTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACTGTGCGAGAAAACAAACTGCTGCTTATGTTTGGAATGACAACCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ACTGTGCGAGAAAACAAACTGCTGCTTATGTTTGGAATGACAACCACAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATCTATCCCTGGGGTCACTCATTTATCTTAATTCTAGGAAACAGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATCTATCCCTGGGGTCACTCATTTATCTTAATTCTAGGAAACAGCAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TAAAGCAAGCCTCTTTGAGGGTACTGCAGCAATTGAAGTGCTGTGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAAAGCAAGCCTCTTTGAGGGTACTGCAGCAATTGAAGTGCTGTGAGAAA

    900     .    :    .    :
    901 AGGAAAAATCTCAGAGTCACA
        |||||||||||||||||||||
 100901 AGGAAAAATCTCAGAGTCACA