seq1 = pF1KE5366.tfa, 570 bp
seq2 = pF1KE5366/gi568815589f_21340507.tfa (gi568815589f:21340507_21541074), 200568 bp

>pF1KE5366 570
>gi568815589f:21340507_21541074 (Chr9)

1-570  (99999-100568)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGCCTCGCCCTTTGCTTTACTGATGGTCCTGGTGGTGCTCAGCTG
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99999 ACGATGGCCTCGCCCTTTGCTTTACTGATGGTCCTGGTGGTGCTCAGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGTCAAGCTGCTCTCTGGGCTGTGATCTCCCTGAGACCCACAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 CAAGTCAAGCTGCTCTCTGGGCTGTGATCTCCCTGAGACCCACAGCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATAACAGGAGGACCTTGATGCTCCTGGCACAAATGAGCAGAATCTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 ATAACAGGAGGACCTTGATGCTCCTGGCACAAATGAGCAGAATCTCTCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTCCTGTCTGATGGACAGACATGACTTTGGATTTCCCCAGGAGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 TCCTCCTGTCTGATGGACAGACATGACTTTGGATTTCCCCAGGAGGAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGATGGCAACCAGTTCCAGAAGGCTCCAGCCATCTCTGTCCTCCATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100199 TGATGGCAACCAGTTCCAGAAGGCTCCAGCCATCTCTGTCCTCCATGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGATCCAGCAGATCTTCAACCTCTTTACCACAAAAGATTCATCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100249 TGATCCAGCAGATCTTCAACCTCTTTACCACAAAAGATTCATCTGCTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGGGATGAGGACCTCCTAGACAAATTCTGCACCGAACTCTACCAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100299 TGGGATGAGGACCTCCTAGACAAATTCTGCACCGAACTCTACCAGCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAATGACTTGGAAGCCTGTGTGATGCAGGAGGAGAGGGTGGGAGAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100349 GAATGACTTGGAAGCCTGTGTGATGCAGGAGGAGAGGGTGGGAGAAACTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCTGATGAATGCGGACTCCATCTTGGCTGTGAAGAAATACTTCCGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100399 CCCTGATGAATGCGGACTCCATCTTGGCTGTGAAGAAATACTTCCGAAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCACTCTCTATCTGACAGAGAAGAAATACAGCCCTTGTGCCTGGGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100449 ATCACTCTCTATCTGACAGAGAAGAAATACAGCCCTTGTGCCTGGGAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTCAGAGCAGAAATCATGAGATCCCTCTCTTTATCAACAAACTTGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100499 TGTCAGAGCAGAAATCATGAGATCCCTCTCTTTATCAACAAACTTGCAAG

    550     .    :    .    :
    551 AAAGATTAAGGAGGAAGGAA
        ||||||||||||||||||||
 100549 AAAGATTAAGGAGGAAGGAA