seq1 = pF1KE5355.tfa, 882 bp
seq2 = pF1KE5355/gi568815588f_75112230.tfa (gi568815588f:75112230_75330986), 218757 bp

>pF1KE5355 882
>gi568815588f:75112230_75330986 (Chr10)

1-31  (98930-98960)   100% ->
32-100  (100001-100069)   100% ->
101-150  (101792-101841)   100% ->
151-303  (106834-106986)   100% ->
304-356  (107075-107127)   100% ->
357-584  (108514-108741)   100% ->
585-735  (110023-110173)   100% ->
736-793  (117415-117472)   100% ->
794-882  (118669-118757)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACCCACGGACAGACTTGCGCGCGTC         CAATGTGTAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  98930 ATGGCGACCCACGGACAGACTTGCGCGCGTCGTA...CAGCAATGTGTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGCCAGAGATATTTTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100011 TCCTCCATCATATGCTGACCTTGGCAAAGCTGCCAGAGATATTTTCAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGGATTTG         GTTTTGGGTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100061 AAGGATTTGGTA...AAGGTTTTGGGTTGGTGAAACTGGATGTGAAAACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAGTCTTGCAGTGGCGTG         GAATTTTCAACGTCCGGTTCATC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101824 AAGTCTTGCAGTGGCGTGGTG...TAGGAATTTTCAACGTCCGGTTCATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 TAATACAGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106857 TAATACAGACACTGGTAAAGTTACTGGGACCTTGGAGACCAAATACAAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGAAAAGTGGAACACTGATAACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106907 GGTGTGAGTATGGTCTGACTTTCACAGAAAAGTGGAACACTGATAACACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGGGAACAGAAATCGCAATTGAAGACCAG         ATTTGTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 106957 CTGGGAACAGAAATCGCAATTGAAGACCAGGTA...TAGATTTGTCAAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TTTGAAACTGACATTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 107086 TTTGAAACTGACATTTGATACTACCTTCTCACCAAACACAGGGTA...CA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    357  AAAGAAAAGTGGTAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGTATAAAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108513 GAAAGAAAAGTGGTAAAATCAAGTCTTCTTACAAGAGGGAGTGTATAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCAATCCATGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108563 CTTGGTTGTGATGTTGACTTTGATTTTGCTGGACCTGCAATCCATGGTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AGCTGTCTTTGGTTATGAGGGCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108613 AGCTGTCTTTGGTTATGAGGGCTGGCTTGCTGGCTACCAGATGACCTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACAGTGCCAAATCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGGGCTACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108663 ACAGTGCCAAATCAAAGCTGACAAGGAATAACTTTGCAGTGGGCTACAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGT         CAATGATGGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 108713 ACTGGGGACTTCCAGCTACACACTAATGTGTA...TAGCAATGATGGGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGAATTTGGAGGATCAATTTATCAGAAAGTTTGTGAAGATCTTGACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110035 AGAATTTGGAGGATCAATTTATCAGAAAGTTTGTGAAGATCTTGACACTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAGTAAACCTTGCTTGGACATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110085 CAGTAAACCTTGCTTGGACATCAGGTACCAACTGCACTCGTTTTGGCATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GCAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCT         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 110135 GCAGCTAAATATCAGTTGGATCCCACTGCTTCCATTTCTGTG...TAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AAAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAGGCTATACTCAGACTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117417 AAAAGTCAACAACTCTAGCTTAATTGGAGTAGGCTATACTCAGACTCTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GGCCTG         GTGTGAAGCTTACACTCTCTGCTCTGGTAGATGGG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117467 GGCCTGGTA...TAGGTGTGAAGCTTACACTCTCTGCTCTGGTAGATGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAGAGCATTAATGCTGGAGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118704 AAGAGCATTAATGCTGGAGGCCACAAGGTTGGGCTCGCCCTGGAGTTGGA

    950 
    879 GGCT
        ||||
 118754 GGCT