seq1 = pF1KE5337.tfa, 777 bp
seq2 = pF1KE5337/gi568815590f_23003122.tfa (gi568815590f:23003122_23217028), 213907 bp

>pF1KE5337 777
>gi568815590f:23003122_23217028 (Chr8)

1-60  (100001-100060)   100% ->
61-166  (108599-108704)   100% ->
167-280  (111536-111649)   100% ->
281-389  (112387-112495)   100% ->
390-777  (113520-113907)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCGGATCCCCAAGACCCTAAAGTTCGTCGTCGTCATCGTCGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCGGATCCCCAAGACCCTAAAGTTCGTCGTCGTCATCGTCGCGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCTGCCA         GTCCTAGCTTACTCTGCCACCACTGCCCGGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCTGCCAGTG...CAGGTCCTAGCTTACTCTGCCACCACTGCCCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGAGGAAGTTCCCCAGCAGACAGTGGCCCCACAGCAACAGAGGCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108630 AGGAGGAAGTTCCCCAGCAGACAGTGGCCCCACAGCAACAGAGGCACAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCAAGGGGGAGGAGTGTCCAGCAG         GATCTCATAGATCAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 108680 TTCAAGGGGGAGGAGTGTCCAGCAGGTG...CAGGATCTCATAGATCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 ACATACTGGAGCCTGTAACCCGTGCACAGAGGGTGTGGATTACACCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111552 ACATACTGGAGCCTGTAACCCGTGCACAGAGGGTGTGGATTACACCAACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTTCCAACAATGAACCTTCTTGCTTCCCATGTACAGTTTGTAAATCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 111602 CTTCCAACAATGAACCTTCTTGCTTCCCATGTACAGTTTGTAAATCAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281        ATCAAAAACATAAAAGTTCCTGCACCATGACCAGAGACACAGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111652 A...CAGATCAAAAACATAAAAGTTCCTGCACCATGACCAGAGACACAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTGTCAGTGTAAAGAAGGCACCTTCCGGAATGAAAACTCCCCAGAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112430 GTGTCAGTGTAAAGAAGGCACCTTCCGGAATGAAAACTCCCCAGAGATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCCGGAAGTGTAGCAG         GTGCCCTAGTGGGGAAGTCCAAGTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 112480 GCCGGAAGTGTAGCAGGTG...CAGGTGCCCTAGTGGGGAAGTCCAAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGTAATTGTACGTCCTGGGATGATATCCAGTGTGTTGAAGAATTTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113545 AGTAATTGTACGTCCTGGGATGATATCCAGTGTGTTGAAGAATTTGGTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAATGCCACTGTGGAAACCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGAACACCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113595 CAATGCCACTGTGGAAACCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGAACACCAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CGGGGACTCCTGCCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGAACACCAGCCCAGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 113645 CGGGGACTCCTGCCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGAACACCAGCCCGGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ACTCCTGCCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGACCACCAGCCCGGGGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113695 ACTCCTGCCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGACCACCAGCCCGGGGACTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGACCACCAGCCCGGGGACTCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113745 TGCCCCAGCTGCTGAAGAGACAATGACCACCAGCCCGGGGACTCCTGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAGCTGCTGAAGAGACAATGACCACCAGCCCGGGGACTCCTGCCTCTTCT
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 113795 CAGCTGCTGAAGAGACAATGATCACCAGCCCGGGGACTCCTGCCTCTTCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CATTACCTCTCATGCACCATCGTAGGGATCATAGTTCTAATTGTGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113845 CATTACCTCTCATGCACCATCGTAGGGATCATAGTTCTAATTGTGCTTCT

    800     .    :
    765 GATTGTGTTTGTT
        |||||||||||||
 113895 GATTGTGTTTGTT