seq1 = pF1KE5328.tfa, 816 bp
seq2 = pF1KE5328/gi568815597r_147059568.tfa (gi568815597r:147059568_147272144), 212577 bp

>pF1KE5328 816
>gi568815597r:147059568_147272144 (Chr1)

(complement)

1-156  (100001-100156)   100% ->
157-323  (104212-104378)   100% ->
324-417  (105206-105299)   100% ->
418-538  (105527-105647)   100% ->
539-672  (109572-109705)   100% ->
673-741  (110365-110433)   100% ->
742-816  (112503-112577)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAAACACCACCAGCGACCGGGTGTCCGGGGAGCGCCACGGCGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAAACACCACCAGCGACCGGGTGTCCGGGGAGCGCCACGGCGCCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGCACGCTCCGAGGGCGCAGGCGGCCATGCCCCGGGGAAGGAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGCACGCTCCGAGGGCGCAGGCGGCCATGCCCCGGGGAAGGAGCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGATCATGGTGGGGAGTACGGACGACCCCAGCGTGTTCAGCCTCCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGATCATGGTGGGGAGTACGGACGACCCCAGCGTGTTCAGCCTCCCTGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCAAG         CTCCCTGGGGACAAAGAGTTTGTATCATGGCAGCA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCAAGGTA...CAGCTCCCTGGGGACAAAGAGTTTGTATCATGGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGATTTGGAGGACTCCGTAAAGCCCACACAGCAGGCCCGGCCCACTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104247 GGATTTGGAGGACTCCGTAAAGCCCACACAGCAGGCCCGGCCCACTGTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCGCTGGTCTGAAGGAGGCAAGGAGGTCTTCATCTCTGGGTCCTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104297 TCCGCTGGTCTGAAGGAGGCAAGGAGGTCTTCATCTCTGGGTCCTTCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AATTGGAGCACCAAGATTCCACTGATTAAGAG         CCATAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 104347 AATTGGAGCACCAAGATTCCACTGATTAAGAGGTG...TAGCCATAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTTGTTGCCATCCTGGACCTCCCTGAGGGAGAGCACCAATACAAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105215 CTTTGTTGCCATCCTGGACCTCCCTGAGGGAGAGCACCAATACAAGTTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGTGGATGGACAGTGGGTTCATGATCCATCAGAG         CCTGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105265 TTGTGGATGGACAGTGGGTTCATGATCCATCAGAGGTA...CAGCCTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTTACCAGTCAGCTTGGCACAATTAACAATTTGATCCATGTCAAGAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105533 GTTACCAGTCAGCTTGGCACAATTAACAATTTGATCCATGTCAAGAAATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGATTTTGAGGTGTTCGATGCTTTAAAGTTAGATTCTATGGAAAGTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105583 TGATTTTGAGGTGTTCGATGCTTTAAAGTTAGATTCTATGGAAAGTTCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGACATCTTGTAGAG         ACCTTTCCAGCTCACCCCCAGGGCCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105633 AGACATCTTGTAGAGGTA...CAGACCTTTCCAGCTCACCCCCAGGGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TATGGTCAAGAAATGTATGCGTTTCGATCTGAGGAAAGATTCAAATCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109598 TATGGTCAAGAAATGTATGCGTTTCGATCTGAGGAAAGATTCAAATCCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACCCATCCTTCCTCCTCATCTACTTCAAGTTATTCTTAACAAAGACACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109648 ACCCATCCTTCCTCCTCATCTACTTCAAGTTATTCTTAACAAAGACACTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATATTTCT         TGTGACCCAGCCTTACTCCCTGAGCCCAACCAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 109698 ATATTTCTGTG...TAGTGTGACCCAGCCTTACTCCCTGAGCCCAACCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTTATGCTGAACCATCTCTATGCATTGTCCATTAAG         GACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110398 GTTATGCTGAACCATCTCTATGCATTGTCCATTAAGGTA...CAGGACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGTGATGGTCCTTAGCGCAACCCATCGCTACAAGAAGAAGTATGTTACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112508 TGTGATGGTCCTTAGCGCAACCCATCGCTACAAGAAGAAGTATGTTACTA

    850     .    :    .    :
    797 CTCTGCTATACAAGCCCATT
        ||||||||||||||||||||
 112558 CTCTGCTATACAAGCCCATT