seq1 = pF1KE5313.tfa, 882 bp
seq2 = pF1KE5313/gi568815587r_30311471.tfa (gi568815587r:30311471_30680373), 368903 bp

>pF1KE5313 882
>gi568815587r:30311471_30680373 (Chr11)

(complement)

1-128  (100001-100128)   100% ->
129-310  (144199-144380)   100% ->
311-536  (184853-185078)   100% ->
537-652  (262741-262856)   100% ->
653-766  (266033-266146)   100% ->
767-882  (268788-268903)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACATGGGATTCCTTCTCAAGGCAAAGTTACCATAACGGTGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACATGGGATTCCTTCTCAAGGCAAAGTTACCATAACGGTGGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTACAGCTCAAACCCCACCCAGGCATTCACGCACTACAACATCAACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTACAGCTCAAACCCCACCCAGGCATTCACGCACTACAACATCAACCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGATTCCAGCCTCCACATGTACATAT         GGTCGACCCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100101 GCAGATTCCAGCCTCCACATGTACATATGTA...TAGGGTCGACCCCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCATATGACACTCCAAAACCAGCGGGCCACACGCGGTTTGTCTGCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144212 CCATATGACACTCCAAAACCAGCGGGCCACACGCGGTTTGTCTGCATCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGACACACACTCCAGAACAGATGGTATCCAGATGCCTTATGGGGACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144262 AGACACACACTCCAGAACAGATGGTATCCAGATGCCTTATGGGGACATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTCTCCACACAGGCGATTTCACCGAGCTGGGACTGCCCTCAGAGGTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144312 TTCTCCACACAGGCGATTTCACCGAGCTGGGACTGCCCTCAGAGGTTAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGTTTAATGACTGGTTAG         GAAACCTGCCATATGAATATAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 144362 AAGTTTAATGACTGGTTAGGTA...CAGGAAACCTGCCATATGAATATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AATAGTGATTGCTGGGAATCATGAACTGACATTTGATAAGGAATTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184875 AATAGTGATTGCTGGGAATCATGAACTGACATTTGATAAGGAATTCATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CAGACCTTGTTAAACAGGACTACTACCGTTTCCCCTCTGTGTCCAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184925 CAGACCTTGTTAAACAGGACTACTACCGTTTCCCCTCTGTGTCCAAATTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAACCAGAGGACTTTGACAATGTTCAGTCCCTCCTGACAAACAGTATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184975 AAACCAGAGGACTTTGACAATGTTCAGTCCCTCCTGACAAACAGTATTTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTACAAGATTCGGAGGTAACAGTGAAGGGATTCAGGATATACGGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185025 CTTACAAGATTCGGAGGTAACAGTGAAGGGATTCAGGATATACGGTGCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTTG         GACCCCGTGGTTTAATGGATGGGGCTTTAACCTACCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 185075 CTTGGTA...AAGGACCCCGTGGTTTAATGGATGGGGCTTTAACCTACCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AGAGGTCAGTCTCTGCTGGACAAGTGGAACCTCATCCCTGAGGGCATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 262778 AGAGGTCAGTCTCTGCTGGACAAGTGGAACCTCATCCCTGAGGGCATTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CATACTCATGACACATGGACCTCCTCTAG         GTTTTCGAGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 262828 CATACTCATGACACATGGACCTCCTCTAGGTA...TAGGTTTTCGAGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGGTTCCAAAGGAGCTTCAAAGAGTGGGCTGTGTGGAGCTGTTAAACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266045 GGGTTCCAAAGGAGCTTCAAAGAGTGGGCTGTGTGGAGCTGTTAAACACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTTCAGAGGCGAGTCCGGCCCAAGCTCCATGTGTTTGGTGGAATCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266095 GTTCAGAGGCGAGTCCGGCCCAAGCTCCATGTGTTTGGTGGAATCCATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AG         GTTATGGCATCATGACCGACGGTTACACAACGTACATCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 266145 AGGTA...CAGGTTATGGCATCATGACCGACGGTTACACAACGTACATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGCCTCGACGTGTACAGTCAGCTTTCAACCGACCAACCCTCCAATTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 268827 ATGCCTCGACGTGTACAGTCAGCTTTCAACCGACCAACCCTCCAATTATA

    900     .    :    .    :    .
    856 TTTGACCTTCCAAACCCACAGGGTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||
 268877 TTTGACCTTCCAAACCCACAGGGTTCC