seq1 = pF1KE5280.tfa, 744 bp
seq2 = pF1KE5280/gi568815581r_57905409.tfa (gi568815581r:57905409_58107137), 201729 bp

>pF1KE5280 744
>gi568815581r:57905409_58107137 (Chr17)

(complement)

1-194  (100001-100194)   100% ->
195-379  (100611-100795)   100% ->
380-552  (101165-101337)   100% ->
553-744  (101538-101729)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGGAGGTGGTGTGATTCGTGGCCCCGCAGGGAACAACGATTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGGAGGTGGTGTGATTCGTGGCCCCGCAGGGAACAACGATTGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCTACGTGGGTAACTTACCTCCAGACATCCGAACCAAGGACATTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCTACGTGGGTAACTTACCTCCAGACATCCGAACCAAGGACATTGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGTGTTCTACAAATACGGCGCTATCCGCGACATCGACCTCAAGAATCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGTGTTCTACAAATACGGCGCTATCCGCGACATCGACCTCAAGAATCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCGGGGGACCGCCCTTCGCCTTCGTTGAGTTCGAGGACCCGCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100151 CGCGGGGGACCGCCCTTCGCCTTCGTTGAGTTCGAGGACCCGCGGTG...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    195    AGACGCGGAAGACGCGGTGTATGGTCGCGACGGCTATGATTACGATG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100608 CAGAGACGCGGAAGACGCGGTGTATGGTCGCGACGGCTATGATTACGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGTACCGTCTGCGGGTGGAGTTTCCTCGAAGCGGCCGTGGAACAGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100658 GGTACCGTCTGCGGGTGGAGTTTCCTCGAAGCGGCCGTGGAACAGGCCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCGGCGGCGGGGGTGGAGGTGGCGGAGCTCCCCGAGGTCGCTATGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100708 GGCGGCGGCGGGGGTGGAGGTGGCGGAGCTCCCCGAGGTCGCTATGGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCCATCCAGGCGGTCTGAAAACAGAGTGGTTGTCTCTG         GAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100758 CCCATCCAGGCGGTCTGAAAACAGAGTGGTTGTCTCTGGTG...CAGGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCCTCCAAGTGGAAGTTGGCAGGATTTAAAGGATCACATGCGTGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101168 TGCCTCCAAGTGGAAGTTGGCAGGATTTAAAGGATCACATGCGTGAAGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGTGATGTATGTTATGCTGATGTTTACCGAGATGGCACTGGTGTCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101218 GGTGATGTATGTTATGCTGATGTTTACCGAGATGGCACTGGTGTCGTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTTTGTACGGAAAGAAGATATGACCTATGCAGTTCGAAAACTGGATAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101268 GTTTGTACGGAAAGAAGATATGACCTATGCAGTTCGAAAACTGGATAACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTAAGTTTAGATCTCATGAG         GGAGAAACTGCCTACATCCGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101318 CTAAGTTTAGATCTCATGAGGTA...TAGGGAGAAACTGCCTACATCCGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTTAAAGTTGATGGGCCCAGAAGTCCAAGTTATGGAAGATCTCGATCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101559 GTTAAAGTTGATGGGCCCAGAAGTCCAAGTTATGGAAGATCTCGATCTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAGCCGTAGTCGTAGCAGAAGCCGTAGCAGAAGCAACAGCAGGAGTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101609 AAGCCGTAGTCGTAGCAGAAGCCGTAGCAGAAGCAACAGCAGGAGTCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GTTACTCCCCAAGGAGAAGCAGAGGATCACCACGCTATTCTCCCCGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101659 GTTACTCCCCAAGGAGAAGCAGAGGATCACCACGCTATTCTCCCCGTCAT

    750     .    :    .    :
    724 AGCAGATCTCGCTCTCGTACA
        |||||||||||||||||||||
 101709 AGCAGATCTCGCTCTCGTACA