seq1 = pF1KE5277.tfa, 660 bp
seq2 = pF1KE5277/gi568815591f_100331426.tfa (gi568815591f:100331426_100533551), 202126 bp

>pF1KE5277 660
>gi568815591f:100331426_100533551 (Chr7)

1-264  (100001-100264)   100% ->
265-483  (101494-101712)   100% ->
484-610  (101838-101964)   100% ->
611-660  (102077-102126)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGGCCTGGATATCGATTCCCGGCTCATCCATTCTGCCCGCCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGGCCTGGATATCGATTCCCGGCTCATCCATTCTGCCCGCCAAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCCGACACTACCTTTCCGAGGAGCTGCGTCTCCCACCCCAGACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCCGACACTACCTTTCCGAGGAGCTGCGTCTCCCACCCCAGACTTTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGGGACCCGGGGGCAGAGGGTGAGGAAGGGACCACCACCGTTCGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGGGACCCGGGGGCAGAGGGTGAGGAAGGGACCACCACCGTTCGAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGAGCTGCTTCCCAGCCTCGCTGACTGCCAGCCGGGGTCCCATCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGAGCTGCTTCCCAGCCTCGCTGACTGCCAGCCGGGGTCCCATCGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCCAAGTGCCCTTGGATGGAGCGGACACATCAGTCTTCCCCAACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCCCAAGTGCCCTTGGATGGAGCGGACACATCAGTCTTCCCCAACAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGTCTTCGTCACG         GGTAATTATGTGCTGGATCGAGATGAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGTCTTCGTCACGGTA...CAGGGTAATTATGTGCTGGATCGAGATGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGGTGGAGGCCCAAACACCTGAGTATGATGTGGTGCTCTGCCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101521 CTGGTGGAGGCCCAAACACCTGAGTATGATGTGGTGCTCTGCCTCAGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CACCAAGTGGGTGCATCTGAACTGGGGAGACGAGGGCCTGAAGCGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101571 CACCAAGTGGGTGCATCTGAACTGGGGAGACGAGGGCCTGAAGCGCATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTCGCCGGATCTACCGGCACCTACGCCCTGGGGGCATCCTGGTCCTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101621 TTCGCCGGATCTACCGGCACCTACGCCCTGGGGGCATCCTGGTCCTAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCCCAACCCTGGTCGTCGTATGGCAAGAGAAAGACTCTTACA        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101671 CCCCAACCCTGGTCGTCGTATGGCAAGAGAAAGACTCTTACAGTG...TA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    484  GAAACGATCTACAAGAACTACTACCGAATCCAATTGAAGCCAGAGCAGT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101837 GGAAACGATCTACAAGAACTACTACCGAATCCAATTGAAGCCAGAGCAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCAGTTCCTACCTGACATCCCCAGACGTGGGCTTCTCCAGCTATGAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101887 TCAGTTCCTACCTGACATCCCCAGACGTGGGCTTCTCCAGCTATGAGCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTGGCCACACCCCACAACACCTCTAAAG         GCTTCCAGCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 101937 GTGGCCACACCCCACAACACCTCTAAAGGTA...CAGGCTTCCAGCGTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .
    624 TGTGTACCTGTTCCACAAGGCCCGATCCCCCAGCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102090 TGTGTACCTGTTCCACAAGGCCCGATCCCCCAGCCAC