seq1 = pF1KE5275.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KE5275/gi568815581r_63780324.tfa (gi568815581r:63780324_63981522), 201199 bp

>pF1KE5275 651
>gi568815581r:63780324_63981522 (Chr17)

(complement)

8-171  (100001-100164)   100% ->
172-291  (100375-100494)   100% ->
292-456  (100587-100751)   100% ->
457-651  (101005-101199)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      8 CAGGCTCCCGGACGTCCCTGCTCCTGGCTTTTGGCCTGCTCTGCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 CAGGCTCCCGGACGTCCCTGCTCCTGGCTTTTGGCCTGCTCTGCCTGTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     58 TGGCTTCAAGAGGGCAGTGCCTTCCCAACCATTCCCTTATCCAGGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCTTCAAGAGGGCAGTGCCTTCCCAACCATTCCCTTATCCAGGCTTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    108 TGACAACGCTATGCTCCGCGCCCGTCGCCTGTACCAGCTGGCATATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGACAACGCTATGCTCCGCGCCCGTCGCCTGTACCAGCTGGCATATGACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    158 CCTATCAGGAGTTT         GAAGAAGCCTATATCCTGAAGGAGCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTATCAGGAGTTTGTA...TAGGAAGAAGCCTATATCCTGAAGGAGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199 AAGTATTCATTCCTGCAGAACCCCCAGACCTCCCTCTGCTTCTCAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100402 AAGTATTCATTCCTGCAGAACCCCCAGACCTCCCTCTGCTTCTCAGAGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    249 TATTCCAACACCTTCCAACAGGGTGAAAACGCAGCAGAAATCT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100452 TATTCCAACACCTTCCAACAGGGTGAAAACGCAGCAGAAATCTGTG...C

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292   AACCTAGAGCTGCTCCGCATCTCCCTGCTGCTCATCCAGTCATGGCTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100585 AGAACCTAGAGCTGCTCCGCATCTCCCTGCTGCTCATCCAGTCATGGCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    340 GAGCCCGTGCAGCTCCTCAGGAGCGTCTTCGCCAACAGCCTGGTGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100635 GAGCCCGTGCAGCTCCTCAGGAGCGTCTTCGCCAACAGCCTGGTGTATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    390 CGCCTCGGACAGCAACGTCTATCGCCACCTGAAGGACCTAGAGGAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100685 CGCCTCGGACAGCAACGTCTATCGCCACCTGAAGGACCTAGAGGAAGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    440 TCCAAACGCTGATGTGG         AGGCTGGAAGATGGCAGCCCCCGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100735 TCCAAACGCTGATGTGGGTG...CAGAGGCTGGAAGATGGCAGCCCCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    481 ACTGGGCAGATCTTCAATCAGTCCTACAGCAAGTTTGACACAAAATCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101029 ACTGGGCAGATCTTCAATCAGTCCTACAGCAAGTTTGACACAAAATCGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    531 CAACGATGACGCACTGCTCAAGAACTACGGGCTGCTCTACTGCTTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101079 CAACGATGACGCACTGCTCAAGAACTACGGGCTGCTCTACTGCTTCAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    581 AGGACATGGACAAGGTCGAGACATTCCTGCGCATCGTGCAGTGCCGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101129 AGGACATGGACAAGGTCGAGACATTCCTGCGCATCGTGCAGTGCCGCTCT

    650     .    :    .    :
    631 GTGGAGGGCAGCTGTGGCTTC
        |||||||||||||||||||||
 101179 GTGGAGGGCAGCTGTGGCTTC