seq1 = pF1KE5218.tfa, 570 bp
seq2 = pF1KE5218/gi568815589f_113156149.tfa (gi568815589f:113156149_113360470), 204322 bp

>pF1KE5218 570
>gi568815589f:113156149_113360470 (Chr9)

1-129  (100001-100129)   100% ->
130-202  (100965-101037)   100% ->
203-371  (102546-102714)   100% ->
372-570  (104124-104322)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCATTCCCACCATATGGGGATGAGCTATATGGACTCCAACAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCATTCCCACCATATGGGGATGAGCTATATGGACTCCAACAGTAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGCAACCTTCTCACCATCACCCAACCACTTCAGCCTCACACTCCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATGCAACCTTCTCACCATCACCCAACCACTTCAGCCTCACACTCCCATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGGAGGAGACAGCAGCATGATGATGATG         CCTATGACCTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100101 GTGGAGGAGACAGCAGCATGATGATGATGGTG...CAGCCTATGACCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACTTTGGCTTTAAGAATGTGGAACTACTGTTTTCCGGTTTGGTGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100977 TACTTTGGCTTTAAGAATGTGGAACTACTGTTTTCCGGTTTGGTGATCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TACAGCTGGAG         AAATGGCTGGAGCTTTTGTGGCAGTGTTTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101027 TACAGCTGGAGGTG...TAGAAATGGCTGGAGCTTTTGTGGCAGTGTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TACTAGCAATGTTCTATGAAGGACTCAAGATAGCCCGAGAGAGCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102576 TACTAGCAATGTTCTATGAAGGACTCAAGATAGCCCGAGAGAGCCTGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGTAAGTCACAAGTCAGCATTCGCTACAATTCCATGCCTGTCCCAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102626 CGTAAGTCACAAGTCAGCATTCGCTACAATTCCATGCCTGTCCCAGGACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AAATGGAACCATCCTTATGGAGACACACAAAACTGTTGG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102676 AAATGGAACCATCCTTATGGAGACACACAAAACTGTTGGGTA...CAGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AACAGATGCTGAGCTTTCCTCACCTCCTGCAAACAGTGCTGCACATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104126 AACAGATGCTGAGCTTTCCTCACCTCCTGCAAACAGTGCTGCACATCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CAGGTGGTCATAAGCTACTTCCTCATGCTCATCTTCATGACCTACAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104176 CAGGTGGTCATAAGCTACTTCCTCATGCTCATCTTCATGACCTACAACGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTACCTCTGCATTGCAGTAGCAGCAGGGGCCGGTACAGGATACTTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104226 GTACCTCTGCATTGCAGTAGCAGCAGGGGCCGGTACAGGATACTTCCTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    524 TCAGCTGGAAGAAGGCAGTGGTAGTGGATATCACAGAGCATTGCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104276 TCAGCTGGAAGAAGGCAGTGGTAGTGGATATCACAGAGCATTGCCAT