seq1 = pF1KE5195.tfa, 468 bp
seq2 = pF1KE5195/gi568815584f_20942993.tfa (gi568815584f:20942993_21143460), 200468 bp

>pF1KE5195 468
>gi568815584f:20942993_21143460 (Chr14)

1-468  (100001-100468)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACCGGCCAGAGCAGGATTCTGCCCCCTTCTGCTGCTTCTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACCGGCCAGAGCAGGATTCTGCCCCCTTCTGCTGCTTCTGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGCTGTGGGTGGCAGAGATCCCAGTCAGTGCCAAGCCCAAGGGCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGGCTGTGGGTGGCAGAGATCCCAGTCAGTGCCAAGCCCAAGGGCATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCATCACAGTGGTTTAAAATTCAGCACATGCAGCCCAGCCCTCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCATCACAGTGGTTTAAAATTCAGCACATGCAGCCCAGCCCTCAAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCAACTCAGCCATGAAAAACATTAACAAGCACACAAAACGGTGCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGCAACTCAGCCATGAAAAACATTAACAAGCACACAAAACGGTGCAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCAACACCTTCCTGCACGAGCCTTTCTCCAGTGTGGCCGCCACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCAACACCTTCCTGCACGAGCCTTTCTCCAGTGTGGCCGCCACCTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGACCCCCAAAATAGCCTGCAAGAATGGCGATAAAAACTGCCACCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGACCCCCAAAATAGCCTGCAAGAATGGCGATAAAAACTGCCACCAGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACGGGCCCGTGTCCCTGACCATGTGTAAGCTCACCTCAGGGAAGTATCC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 100301 CACGGGGCCGTGTCCCTGACCATGTGTAAGCTCACCTCAGGGAAGCATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAACTGCAGGTACAAAGAGAAGCGACAGAACAAGTCTTACGTAGTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAACTGCAGGTACAAAGAGAAGCGACAGAACAAGTCTTACGTAGTGGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTAAGCCTCCCCAGAAAAAGGACTCTCAGCAATTCCACCTGGTTCCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTAAGCCTCCCCAGAAAAAGGACTCTCAGCAATTCCACCTGGTTCCTGTA

    450     .    :    .
    451 CACTTGGACAGAGTCCTT
        ||||||||||||||||||
 100451 CACTTGGACAGAGTCCTT